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researcher / Alain Denise

Alain Denise

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Disciplines:

Applied sciences

Computer sciences

Medicine and health

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Thesis:

Methodes de generation aleatoire d'objet combinatoires de grande taille et problemes d'enumeration

Directed Thesis:

Passage à l'échelle, propriétés et qualité des algorithmes de classements consensuels pour les données biologiques massives

New approaches for processing and annotations of high-throughput metabolomic data obtained by mass spectrometry

Alignement pratique de structure-séquence d'ARN avec pseudonœuds

Prédiction de structure tridimensionnelle de molécules d’ARN par minimisation de regret

Agrégation de classements avec égalités : algorithmes, guides à l'utilisateur et applications aux données biologiques

Nouvelles approches bioinformatiques pour l'étude à grande échelle de l'évolution des activités enzymatiques

Analyses bioinformatiques et classements consensus pour les données biologiques à haut débit

Algorithmique de l'alignement structure-séquence d'ARN : une approche générale et paramétrée

Algorithmes pour l'étude de la structure secondaire des ARN et l'alignement de séquences

Approches combinatoires pour le test statistique à grande échelle

Aspects algorithmiques des réarrangements génomiques : duplications et ordres partiels

Modélisation de la complexité et de la dynamique des simulations multi-agents : application pour l’analyse des phénomènes émergents

Etude algorithmique et statistique de la comparaison des structures secondaires d'ARN

Modélisation de séquences génomiques structurées, génération aléatoire et applications

Algorithmes de graphes pour l'analyse des séquences et structures génomiques