researcher / Dominique Lavenier

Dominique Lavenier

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Disciplines:

Computer sciences
Electrical engineering
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Thesis:

Micmacs : un reseau systolique lineaire programmable pour le traitement des chaines de caracteres

Directed Thesis:

Structural variant genotyping with long read data
Nouvelles techniques d'extraction de motif pour l'étude d'association à l'échelle du génome
Métagénomique comparative de novo à grande échelle
Nouvelles approches pour l'exploitation des données de séquences génomique haut débit
Concevoir et partager des workflows d’analyse de données : application aux traitements intensifs en bioinformatique
Comparaison de novo de données de séquençage issues de très grands échantillons métagénomiques : application sur le projet Tara Oceans
Exploiting parallel features of modern computer architectures in bioinformatics : applications to genetics, structure comparison and large graph analysis
Computational methods for de novo assembly of next-generation genome sequencing data
Parallelization on graphic hardware : contributions to RNA folding and sequence alignment
Reefs : une architecture reconfigurable pour la stéréovision embarquée en contexte temps-réel
Contrôle en ligne des systèmes multiprocesseurs hétérogènes embarqués : élaboration et validation d’une architecture
Architectures reconfigurables pour la recherche par automates de motifs dans les séquences génomiques
Architecture parallèle reconfigurable pour le filtrage des banques de données non structurées : application à la génomique
Inférence d'automates finis non déterministes par gestion de l'ambigui͏̈té, en vue d'applications en bioinformatique
Implémentation automatique de réseaux réguliers sur circuits reconfigurables