Modélisation par la méthode de Monte-Carlo de propriétés thermodynamiques de chaines macromoléculaires soumises aux effets de différents solvants : application aux polypeptides
Institution:
Nancy 1Disciplines:
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Les propriétés conformationnelles et thermodynamiques de chaines de polypeptides soumises aux effets de différents environnements sont étudiées par la méthode de Monte-Carlo. Dans un premier temps, les effets du solvant sur les conformations sont simulés par l'écrantage de certaines interactions à longue distance. La différence d'entropie et d'énergie libre conformationnelles accompagnant le repliement d'une chaine polypeptidique sont estimées par des approches de calcul de type Monte-Carlo. Les modifications des conformations des chaînes dues aux effets d'un solvant sont ensuite prises en compte par le calcul de l'énergie d'hydratation de la molécule appréciée par la méthode des aires des surfaces atomiques accessibles au solvant. Des transitions coopératives de formes sont ainsi mises en évidence lors du transfert d'homopolypeptides d'un milieu aqueux vers un milieu apolaire. Puis une application à l'angiotensine ii montre une modification de la structure tridimensionnelle de l'hormone lors du passage d'un milieu aqueux vers celui d'une membrane biologique