Dispositif interférométrique pour la cytométrie : optomécanique en acousto-fluidique
Institution:
Université Côte d'AzurDisciplines:
Directors:
Abstract EN:
In the past years a growing demand for label-free cell analysis has emerged. This demand answers the need for cell analysis in its developing stages and, perhaps more importantly, to study cell physiological state in a simpler way than using fluorescence-based analyses. Mechanical and optical properties of cells are emerging as powerful biomarkers to discriminate cells. The cell deformation induced by acoustic pressure is measured with the Acoustofluidic Interferometric Device, developed in this Thesis, and allows for studying the cells deformability in a way similar to what is done for the analysis of the Young modulus. Deformability is an integral biomarker that summarizes cell gene expression, while the cell refractive index is related to the density of proteins in the cytoskeleton. The Acoustofluidic Interferometric Device, developed for the measurement of optomechanical cell properties on a cytometric basis, is detailed described and characterized in this thesis. The device enables the assessment of size, deformability and refractive index (or a combination of them) of non-adherent cells by means of a low finesse Fabry Perot resonator and acoustic manipulation.When an acoustically focussed cell (or another micro-sized particle) crosses the axis of the Fabry-Perot cavity it will perturb the resonator’s fringe pattern governed by the Airy’s transmission function. Such perturbation can be characterized and analyzed by means of the parameters ρ (radii of the circular interference fringes), Full Width at Half Maximum of the individual fringe and by the distance between fringes (Free Spectral Range). The analysis of the perturbation enables the assessment of the cell’s optomechanical properties. Measurement of the deformability of Algae and Yeast cells has been carried out to test the instrument’s performance and compared to the equivalent perturbation introduced by Microgel beads and Polystyrene spheres as controls. The experiment is based on the cell-induced fringe pattern perturbation images analysis. Images are acquired under two different conditions; 1) acoustic focussing and 2) acoustically induced deformation. 180 independent intensity profiles are retrieved and analyzed for each image, allowing for statistical analysis of the parameters: cell focal length and perturbed resonator Finesse. The results show a change in the optomechanical properties of the Algae, Yeast and Microgel while the Polystyrene sample remains virtually unchanged, as expected since Polystyrene is much stiffer than a cell and cannot be deformed by the pressure field of the instrument. These results show that the acoustofluidic technique presented here is useful to detect and measure different optomechanical properties which, potentially, can be used as label free biomarkers in clinical diagnosis.
Abstract FR:
Au cours des dernières années, une demande croissante d’analyse cellulaire sans étiquette est apparue. Cette demande répond au besoin d’analyse cellulaire dans ses étapes de développement et, peut-être plus important encore, d’étudier l’état physiologique des cellules d’une manière plus simple que d’utiliser des analyses basées sur la fluorescence. Les propriétés mécaniques et optiques des cellules deviennent de puissants biomarqueurs pour discriminer les cellules. La déformation cellulaire induite par la pressionacoustique est mesurée avec le Dispositif Interférométrique Acoustofluidique, développé dans cette thèse, et permet d’étudier la déformabilité cellulaire d’une manière similaire à ce qui est fait pour l’analyse du module d’Young. La déformabilité est un biomarqueur intégral qui résume l’expression du gène cellulaire, tandis que l’indice de réfraction cellulaire est lié à la densité des protéines dans le cytosquelette. Le dispositif interférométrique acoustofluidique, développé pour la mesure des propriétés optomécaniques des cellules sur une base cytométrique, est décrit et caractérisé en détail dans cette thèse. L’appareil permet d’évaluer la taille, la déformabilité et l’indice de réfraction (ou une combinaison de ceux-ci) de cellules non adhérentes au moyen d’un résonateur Fabry-Perot de faible finesse et d’une manipulation acoustique. Lorsqu’une cellule focalisée par le champ acoustique (ou une autre particule de micro-taille) croise l’axe de la cavité Fabry-Perot, elle perturbe le motif de franges du résonateur, décrites par la fonction de transmission d’Airy. Une telle perturbation peut être caractérisée et analysée au moyen des paramètres ρ (rayons des franges d’interférence circulaires), pleine largeur à mi-maximum de la frange individuelle et distance entre les franges (intervalle spectrale libre). L’analyse de la perturbation permet d’évaluer les propriétés optomécaniques de la cellule. La mesure de la déformabilité des algues et descellules de levure a été réalisée pour tester les performances de l’instrument et comparée à la perturbation équivalente introduite par les billes de microgel et par des sphères de polystyrène comme témoins. L’expérience est basée sur l’analyse des images de perturbation des franges induites par les cellules. Lesimages sont acquises dans deux conditions différentes; 1) focalisation acoustique et 2) déformation induite acoustiquement. 180 profils d’intensité indépendants sont récupérés et analysés pour chaque image, permettant une analyse statistique des paramètres: distance focale cellulaire et Finesse du résonateur perturbé. Les résultats montrent un changement dans les propriétés optomécaniques des algues, de la levure et du microgel tandis que l’échantillon de polystyrène reste pratiquement inchangé, comme prévu, car le polystyrène est beaucoup plus rigide qu’une cellule et ne peut pas être déformé par le champ de pression de l’instrument. Ces résultats montrent que la technique acoustofluidique présentée ici est utile pour détecter et mesurer différentes propriétés optomécaniques qui, potentiellement, peuvent être utilisées comme biomarqueurs sans étiquette dans le diagnostic clinique.