Abstract FR:

Il arrive qu'une carte densite electronique d'une macromolecule amelioree par la methode de lissage du solvant ou par la technique du pseudo-derive isomorphe (ou technique ipd) contient encore des volumes non interpretables. Une telle carte calculee a moyenne resolution (2,5 angstroms) permet en principe de construire une enveloppe moleculaire non aberrante. Pour ameliorer l'interpretabilite et pour accroitre la resolution apparente d'une telle carte, nous proposons une nouvelle methode: la methode d'enveloppe de chaine. Cette methode exploite l'information provenant de la presence d'un vide intramoleculaire et l'information provenant des reflexions a resolutions elevees qui n'ont pas ete phasees initialement. Des phases sont calculees adequatement, au-dela de la resolution initiale, en utilisant les formules que luzzati a propose en 1955. Elles sont ensuite combinees avec les phases initiales, et affinees par la technique ipd. Nous proposons aussi une nouvelle approche pour affiner les enveloppes moleculaires obtenues par la procedure de wang-leslie, l'affinement consiste a inclure dans la region du solvant les volumes du vide intramoleculaire contigus au solvant. Ces methodes appliquees a la structure de la collagenase et de la methionyl-trna synthetase ont permis de corriger les erreurs de construction des modeles atomiques, d'une maniere, de rendre les modeles plus precis. Pour la methionyl-trna synthetase, la resolution de la carte s'eleve de 2,5 angstroms, la geometrie du modele s'est amelioree et plusieurs parties peripheriques du peptide (parties 57-68, 80-90, 170-177, 333-337, 520-530) sont observables