thesis

Simulations de la dynamique moléculaire de cryptands et cruptates cationiques : de la phase gazeuse à la phase liquide

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Jan. 1, 1991

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Ce travail de modélisation moléculaire a permis d'obtenir une vue microscopique approfondie de la structure du cryptand 222 et de ses cryptates en phase gazeuse et en solution. A partir d'une exploration de la CDB (base de données cristallographiques de Cambridge), d'un échantillonnage de leur espace conformationnel par dynamique moléculaire à haute température, et de simulations de dynamique moléculaire dans l'eau et le méthanol. Les interactions ligand/solvant ont été discutées et en particulier, le rôle que jouent les liaisons o-h-o-h-o entre des composés polyéthers et des molécules d'eau dans la stabilisation de certaines de leurs conformations. La sélectivité du cryptand pour différents cations alcalins dans l'eau et le méthanol a également été discutée. Au point de vue méthodologique, cette étude met en évidence la nécessite d'inclure dans ces simulations une représentation explicite du solvant.