thesis

Analyse de la structure tridimensionnelle du site antigénique immunodominant de la nucléocapside du virus de l'hépatite C par résonance magnétique nucléaire

Defense date:

Jan. 1, 1997

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Institution:

Lyon 1

Disciplines:

Directors:

Abstract EN:

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Abstract FR:

Le virus de l'hepatite c (vhc) est un des virus carcinogenes repertories chez l'homme. Des etudes antigeniques de la proteine de la nucleocapside ont demontre que sa sequence 2-45 contenait les epitopes immunodominants et suggeraient que certains de ceux-ci etaient de type conformationnel. Pour comprendre les relations structure-antigenicite de cette region de la nucleocapside nous avons entrepris la determination de sa structure 3d grace a des peptides synthetiques. L'analyse structurale par rmn des peptides en solution aqueuse montre la presence d'une conformation helicoidale au cur de la sequence 2-45 de la nucleocapside. Apres stabilisation par addition de trifluoroethanol, les modeles tridimensionnels obtenus montrent que la region structuree est en fait constituee par un motif 3d particulier de type helice-boucle-helice (les deux helices etant maintenues perpendiculaires l'une par rapport a l'autre). Pour verifier l'importance de ce motif structural dans l'antigenicite, un peptide ne contenant que la sequence correspondant a ce motif a ete synthetise. Ce peptide qui contient bien le motif helice-boucle-helice est qualitativement aussi antigenique que la sequence 2-45 entiere. Par contre, la substitution de la l-proline presente dans la boucle par une proline de serie d conduit a la perte de la structure tertiaire du motif ainsi qu'a la disparition de la reconnaissance par les anticorps. L'ensemble des resultats obtenus demontre donc que le motif 3d helice-boucle-helice contient au moins un epitope conformationnel essentiel a l'immunoreactivite de cette region de la nucleocapside. Ce travail constitue la premiere determination de la structure 3d d'une region de la nucleocapside du vhc. Il apporte des informations fondamentales pour ameliorer la selectivite des tests de depistage serologique et pour rationaliser les strategies de lutte contre ce virus