Rôle de l'agrégation et de la formation des ponts disulfure dans la génération de structures amyloïdes par les protéines intrinsèquement déstructurées : prions et caséines
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La famille des Protéines Intrinsèquement Déstructurées englobe de nombreuses protéines aux fonctions diverses. Certaines de ces protéines peuvent changer de structure et s'agréger sous la forme de fibrilles amyloïdes. Certaines transformations amyloïdes générant des agents pathogènes suscitent un intérêt particulier. L’objectif de cette thèse était de mettre en évidence les facteurs ayant une influence sur l'agrégation et la transformation amyloïde des protéines naturellement flexibles et surtout, d'étudier le rôle des ponts disulfure dans ces processus. Les caséines du lait bovin, sous formes natives, recombinantes et de mutants, et la protéine prion ovine ont été choisies comme objets de ce travail. Le repliement initial des caséines et de la protéine prion prédétermine leur potentialité à s'agréger et à se replier parfois aussi sous forme amyloïde. Les expériences menées avec les mutants recombinants de la caséine bêta, dans lesquels certains résidus de sérine ont été mutés en cysteines ont montré que la caséine bêta mutée de la sorte acquiert la capacité à se dimériser. Le mutant possédant un résidu de cystéine en position N-terminale dimérise plus facilement et plus rapidement que le mutant ayant la cysteine introduite en position C-terminale. L’introduction de résidus cystéyle par homocystéinylation des protéines pour a permis d'observer les différents modes d'agrégation des différentes caséines (alphaS1, bêta et kappa) ainsi que la formation, parfois, de structures amyloïdes. L'étude de l'agrégation des protéines prion recombinantes ovines après chauffage, en présence de concentrations différentes en phospholipides et après homocystéinylation a montré qu'en fonction de la concentration, les phospholipides peuvent orienter l'agrégation de la protéine prion vers un repliement amyloïde ou autre. L'homocysteinylation de la protéine prion ovine n'a qu’une influence amyloïdogène. Ceci permet de formuler une hypothèse selon laquelle certains effets pathologiques observés dans le cas des hyper homocystéinémies peuvent être causés par l'apparition d’agrégats amyloïdes des IUP après leur homocysteinylation