Structures en phase gazeuse et en phase liquide de systèmes moléculaires chargés d'intérêt biologique
Institution:
Paris 13Disciplines:
Directors:
Abstract EN:
This work presents the study of the acetylcholine neurotransmitter and its agonists, nicotine and muscarine through infrared spectroscopy. This study has been conducted both in gas-phase and aqueous phase. The used method for the isolated molecules is infrared multiphoton dissociation (IRMPD) coupled to mass spectrometry with the radiation isued from the free electron laser CLIO. For molecules in acid aqueous phase, Fourier-transform spectroscopy has been employed. The experimental results have been interpreted first trough a systematic conformational search at different levels of quantum chemistry followed by optimization of geometries and determination of vibrational frequencies. The emphasis has been set upon the search of pharmacophores. The conforntation between theory and experments has allowed a quantitative evaluation of structural modifications as well as the switch from the inactive to the bioactive form of nicotine due to the progressive addition of explicit water molecules.
Abstract FR:
Ce mémoire présente l'étude du neurotransmetteur acétylcholine et de ses agonistes, nicotine et muscarine, à l'aide de la spectroscopie infrarouge. Cette étude a été menée à la fois en phase gazeuse et en phase aqueuse. La méthode utilisée pour les molécules isolées est la dissociation multiphotonique infrarouge (IRMPD) couplée à la spectrométrie de masse à l'aide du rayonnement issu du laser à électron libre CLIO. Pour les molécules en phase acqueuse acide, la spectroscopie par transformée de Fourier a été employée. Les résultats expérimentaux ont été interprétés tout d'abord par une recherche conformationnelle systématique des differents minima de la surfaces d'énergie potentielle par differentes méthodes de chimie quantique, suivi d'une optimisation des géométries et calculs des fréquences de vibration. L'accent a été mis sur la rechcerche de pharmacophores. La confrontation théorie expérience a permis d'évaluer quantitativement les modifications de structure ainsi que le passagede la forme inactive de la nicotine à sa forme bioactive entraînées par l'adjonction progressive de molécules d'eau sous forme explicite.