thesis

Etude de pectines par spectroscopie de resonance magnetique nucleaire

Defense date:

Jan. 1, 1999

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Institution:

Paris 7

Disciplines:

Abstract EN:

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Abstract FR:

Au sein de la paroi des cellules vegetales en developpement, les pectines -polyosides a structure primaire variable- participent activement au metabolisme de la plante (role de maintien mecanique, regulation du transport des petites molecules, roles dans les phenomenes de croissance ou les mecanismes de defense). L'etude de la relaxation des noyaux 1 3c par rmn nous a permis d'obtenir un modele dynamique de la structure secondaire de pectines non esterifiees, i. E. Des segments de chaine en conformation etendue d'une dizaine de nanometres de longueur. Afin de suivre une approche similaire pour des pectines esterifiees, dont les chaines sont majoritairement associees a temperature ambiante, nous avons mis au point un protocole de depolymerisation partielle par chauffage a basse pression. Cela nous a permis d'obtenir des chaines compatibles avec l'emploi de la rmn a haute resolution. Ainsi, parallelement a l'exploration de l'espace des conformations secondaires basee sur l'etude des parametres de relaxation 1 3c -etude en cours-, nous avons developpe une methode d'analyse du mode d'action de trois pectinemethylesterases (pme) par rmn, ainsi que par des mesures d'activites enzymatiques et des simulations numeriques. Ce travail a apporte des lecons nouvelles. Tout d'abord, quelque soit l'enzyme impliquee, au moins une unite acide de la chaine est necessaire a l'adhesion de l'enzyme au substrat en plus de l'ose esterifie situe dans le site catalytique de l'enzyme. De plus, la position du sucre conditionnel est differente pour une enzyme vis-a-vis des deux autres. Ce point est important, puisque la nature des produits formes tout au long de la reaction de de-esterification depend de la position de ce sucre. En effet, nous avons observe que le mode d'action variait en fonction du ph, alors que la position et la nature du sucre conditionnel demeuraient invariantes, et en consequence, que ce sucre particulier etait a l'origine de la specificite des produits de la reaction.