Dynamic combinatorial chemistry : Exploration using biological receptors
Institution:
Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008)Disciplines:
Directors:
Abstract EN:
Dynamic combinatorial chemistry (DCC) has recently been introduced as a new and attractive approach for generating and screening large numbers of library compounds in one step. Based upon the reversible interconnection between library components, the self-adjusting process give access to selection and amplification of the best binder in the presence of a target. In this thesis, two biological targets were chosen to explore the DCC approach. The reversibility of the system was achieved using disulfide interchange or reversible acyl hydrazone formation. Firstly, a dynamic library of acetylcholinesterase inhibitors was generated through disulfide exchange. The reversibility of the system was observed by NMR spectroscopy. Upon scrambling 5 initial homodisulfides in the presence of a reducing agent, a 15-compound library was produced. The library components were analyzed by ESI-MS and CE. Secondly, a dynamic combinatorial library of acetylcholinesterase inhibitors was further generated through reversible acyl hydrazone formation. The pre-equilibrated process was applied to produce a dynamic library composed of 66 possible species, from a set of 13 initial aldehyde and hydrazide building blocks. Using a technique called dynamic deconvolution, a highly potent inhibitor was identified with IC50 in the nanomolar range. Finally, the pre-equilibrated process combined with the dynamic deconvolution technique was further studied to identify HPr kinase/phosphatase inhibitors. From a set of 21 initial aldehyde and hydrazide builiding blocks, a dynamic library of 440 possible compounds was formed in one operation. A bis-cationic heterocyclic ligand was identified as a relatively potent inhibitor, displaying an IC50 in the micromolar range.
Abstract FR:
La chimie combinatoire dynamique a été récemment introduite comme une approche nouvelle et attractive pour générer et cribler un grand nombre de bibliothèques de composés en une seule étape. Basé sur l'interconnexion réversible entre les composés de la bibliothèque, le processus d'auto-ajustement donne accès à la sélection et à l'amplification du meilleur inhibiteur en présence d'une cible. Au cours de cette thèse, nous avons choisi deux cibles biologiques qui nous ont permis d'explorer l'approche de la chimie combinatoire dynamique. La réversibilité du système a été rendue possible en utilisant l'échange de disulfures ou la formation réversible d'acyl hydrazones. Premièrement, une bibliothèque dynamique d'inhibiteurs d'acétylcholinestérase a été générée grâce à l'échange de disulfures. Nous avons observé la réversibilité du système à l'aide de la spectroscopie de RMN. A partir d'un mélange initial de 5 homodisulfures en présence d'un agent réducteur, une bibliothèque contenant 15 composantes a été obtenue. Les composantes de cette bibliothèque ont été mises en évidence par SM-ES et par EC. Deuxièmement, une bibliothèque combinatoire dynamique d'inhibiteurs d'acétylcholinesterase a été générée en se basant sur la formation réversible d'acyl-hydrazones. Le processus pré-équilibré a été utilisé pour obtentir d'une bibliothèque dynamique composée de 66 espèces possibles, à partir de 13 unités de bases. Nous avons ensuite identifié l'inhibiteur très puissant (IC50 et Ki de l'ordre de nM), en utilisant la méthode de la déconvolution dynamique. Finalement, le processus pré-équilibré combiné à la technique de la déconvolution dynamique a été employé pour identifier les inhibiteurs de la HPr kinase/phosphatase. Ainsi, nous avons pu préparer une bibliothèque dynamique constituée de 440 composés possibles, en une seule étape, à partir de 21 unités de bases. Le ligand hétérocyclique bis-cationique s'est révélé un inhibiteur relativement puissant (IC50 de l'ordre de mM).