Simulation par dynamique moleculaire d'ions libres et complexes par des recepteurs macrocycliques en solution. Influence du solvant sur la conformation des recepteurs, la selectivite de complexation et la nature des paires d'ions
Institution:
Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008)Disciplines:
Directors:
Abstract EN:
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Abstract FR:
Cette these est consacree a l'etude, par simulation de dynamique moleculaire, de la solvatation de paires d'ions libres ou complexees dans l'eau et l'acetonitrile. Nous avons etudie l'impact du solvant sur les conformations du cryptand 222 et de l'ether-couronne 18c6. Des cations libres (li#+-cs#+, ca#2#+ et eu#3#+) puis complexes par le 222 et le 18c6 ont ete simules dans l'acetonitrile. Nous avons fait ces calculs avec un contre-ion, pour tester la stabilite de la paire intime en fonction du solvant (eau et acetonitrile). L'anion cl#- et l'anion picrate ont ete compares, et leur solvatation decrite en detail. Par perturbation thermodynamique, nous avons effectue dans l'acetonitrile des calculs d'affinite relative de complexation d'ions alcalins par le 222 et reproduit la selectivite experimentale pour k#+ par rapport a li#+, na#+, rb#+ et cs#+. La paire d'ions intime pic#-#. #. #. Pic#- a ete comparee dans l'eau et l'acetronitrile par dm, et par calcul de potentiel de force moyenne nous avons compare les paires intimes/separees en fonction de la distance separant les deux ions (k#+cl#-, 18c6/k#+cl#-,k#+pic#- et pic#-pic#-). Enfin, des simulations d'ionophores ont ete effectuees a une interface liquide-liquide (eau/chloroforme) explicitement representee. Nous avons considere successivement le 222 libre, puis complexe (222/k#+), en presence ou non d'un contre-ion (cl#- et pic#-) ainsi que le complexe de cation divalent (18c6/sr#2#+2pic#-)