thesis

Identification and functional analysis of new coregulators of the nuclear receptor PPARγ (Peroxisome Proliferator-Activated Receptor Gamma)

Defense date:

Jan. 1, 2004

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Directors:

Abstract EN:

The peroxisome proliferator-activated receptor g (PPARg) is a nuclear receptor highly expressed in adipose tissue. It has a crucial role in lipid metabolism and glucose homeostasis. The activity of this transcription factor can be modulated by ligands but also by proteins called coregulators. We wanted to identify new coregulators of PPARg. Several novel potential coregulators of PPARg were identified by a yeast two-hybrid screening of a human adipose tissue cDNA library, with PPARg DE domain as bait. We analyzed two of them: BRG1/Brm-associated factor of 60kDa, subunit c (BAF60c) and Scaffold attachment factor B1 (SAFB1). BAF60c is a component of the chromatin remodeling complex SWI/SNF (mating type switching/sucrose non-fermenting). We identified a second isoform of BAF60c that we called BAF60c2. Both isoforms are ubiquitous nuclear proteins binding to transcription factors and acting as coactivators of nuclear receptors. No role of BAF60c isoforms was demonstrated in adipocyte differentiation as well as cell proliferation. SAFB1 is an ubiquitous nuclear protein interacting with nuclear receptors. SAFB1 inhibits the transcriptional activity of some nuclear receptors such as PPARg and FXRa and is hence a corepressor. The expression level of SAFB1 evolves during adipocyte differentiation, with the highest level coinciding with the clonal expansion phase. We suggest that SAFB1 may influence cell proliferation and differentiation decisions. We identified and characterized novel coregulators of nuclear receptors. The data obtained need to be positioned in a highly complex molecular context. The balance between all the factors is of crucial importance to determine transcriptional activity. Studies in genetically modified mice will help to evaluate the physiological impact of the protagonists. This should give us a better view of the links between nutrient-associated external stimuli and gene regulation and ultimately lead to the elaboration of new therapeutic strategies.

Abstract FR:

Le récepteur g activé par les proliférateurs de péroxysomes (PPARg) est un récepteur nucléaire fortement exprimé dans le tissu adipeux. Il joue un rôle crucial dans le métabolisme des lipides et l'homéostasie du glucose. L'activité de ce facteur de transcription est modulée par des ligands, mais aussi par des protéines nommées corégulateurs. Nous souhaitions identifier de nouveaux corégulateurs de PPARg. Le criblage par double-hybride dans la levure d'une banque d'ADNc de tissu adipeux humain avec le domaine DE de PPARg comme appât a permis d'identifier plusieurs corégulateurs potentiels de PPARg. Deux d'entre-eux ont été caractérisés : la sous-unité c du facteur de 60kDa associé à BRG1/Brm, nommée BAF60c et le facteur B1 d'ancrage à la matrice nucléaire, appelé SAFB1. BAF60c fait partie du complexe SWI/SNF de remodelage de la chromatine. Nous avons identifié une deuxième isoforme : BAF60c2. Les deux isoformes sont des protéines nucléaires ubiquistes. Elles se lient à divers facteurs de transcription et coactivent les récepteurs nucléaires. BAF60c n'est impliqué ni dans la différenciation adipocytaire ni dans la prolifération cellulaire. La protéine nucléaire ubiquiste SAFB1 se lie aux récepteurs nucléaires et inhibe leur activité transcriptionnelle. Son niveau d'expression évolue au cours de la différenciation adipocytaire. SAFB1 pourrait influencer le choix entre prolifération cellulaire et différenciation cellulaire. Nous avons identifié et caractérisé de nouveaux corégulateurs des récepteurs nucléaires. Les données obtenues doivent être replacées dans un contexte moléculaire complexe. Des études dans des souris génétiquement modifiées nous aideront à évaluer l'impact physiologique de chaque protagoniste. Cela nous permettra d'obtenir une meilleure vue globale du faisceau de liens moléculaires existant entre la régulation génique et les stimuli externes associés à la nutrition et conduira à terme à l'élaboration de nouvelles stratégies thérapeutiques.