Caractérisation moléculaire intraspécifique et phylogénie comparée de deux Betacoronavirus de clade A : HCoV-OC43 et BCoV
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CaenDisciplines:
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Abstract EN:
Coronaviruses are characterized by an important evolutionary potential by genetic recombination and single nucleotide polymorphisms. These events could lead to the successful emergence of a new variant in a new host population, following a species barrier crossing. One such event occurred at the end of the 19th century, with the emergence of hcov-oc43 from bcov. Genotyping of hcov-oc43 has made it possible to show an intraspecific diversification into numerous genotypes, including recombinant variants. In parallel, genotyping of bcov did not reveal recombinant events. However, we observed an organization of bcov with a geographical distribution, with a european cluster and an american/asian cluster. There is a need for monitoring the emergence of coronaviruses in the human population from an animal reservoir, such as has been seen in the emergence of sars-cov and mers-cov at the origin of epidemics associated with global mortality rates of around 10% and 40%, respectively.
Abstract FR:
Les coronavirus sont caracterises par un potentiel evolutif important par l’intermediaire de recombinaisons genetiques et de mutations ponctuelles. Ces evenements peuvent avoir pour consequences l’emergence reussie d’un nouveau variant dans une nouvelle population hote, apres un franchissement de barriere d’espece. L’un de ces franchissement inter-especes a eu lieu a la fin du xixeme siecle avec l’emergence du hcov-oc43 a partir du bcov. Le genotypage du hcov-oc43 a permis de mettre en evidence une diversification intraspecifique en de nombreux genotypes incluant des genotypes recombinants. Parallelement, le genotypage du bcov n’a pas permis d’observer d’evenements de recombinaisons. Cependant, nous avons observe une organisation des bcov selon une distribution geographique avec un cluster amerique/asie et un cluster europe. L’emergence d’un coronavirus dans la population humaine a partir d’un reservoir animal doit faire l’objet d’une surveillance, comme le montre l’emergence du sars-cov et le mers-cov, a l’origine d’epidemies associees a des mortalites globales d’environ 10% et 40% respectivement.