thesis

Synthèse et interaction de PNA ciblant l'ARN TAR du VIH-1

Defense date:

Jan. 1, 2007

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Institution:

Nice

Disciplines:

Chemistry

Authors:

Directors:

Abstract EN:

The drugs used in anti-HIV polytherapy target viral proteins (reverse transcriptase, protease, gp41). These therapies made it possible to reduce the death rate but generate many side effects and lead to emergence, sometimes very fast, of resistant strains to the drugs used. The research for molecules which act new viral targets thus remains necessary. A track consists in targeting fragments of the RNA of the HIV which is implied in biological processes essential with the viral multiplication and whose sequences are preserved in the majority of the viral strains. Within this framework, the HIV-1 TAR RNA fragment constitutes a privileged target. During this work, we developed two strategies in order to target and to inhibit the biological functions of TAR RNA. A first strategy consisted in working out cyclic PNA “antisense” (Peptide Nucleic Acids : RNA/DNA analogues), likely to establish a very stable and specific complex with the TAR RNA loop. The second strategy consisted of the development of one conjugate of arginine and PNA, simultaneously targeting the TAR RNA bugle and loop. Initially, we thus developed the synthesis, on solid phase, of these various molecules. Then their interaction with TAR RNA was evaluated by thermal denaturation, followed by UV spectroscopy. These studies showed that the cyclic PNA form a very stable and specific complex with TAR RNA. In the same way, an interaction enters combined arginine and PNA and TAR RNA were highlighted.

Abstract FR:

Les médicaments utilisés en polythérapie anti-VIH ciblent des protéines virales (transcriptase inverse, protéase, go41). Ces thérapies ont permis de réduire le taux de mortalité mais génèrent de nombreux effets secondaires et conduisent à l’émergence, parfois très rapide, de souches résistantes aux médicaments utilisés. La recherche de molécules qui agissent sur de nouvelles cibles virales reste donc nécessaire. Une piste consiste à cibler des fragments de l’ARN du VIH qui sont impliqués dans es processus biologiques essentiels à la multiplication virale et dont les séquences sont conservées dans la plupart des souches virales. Dans ce cadre, le fragment d’ARN TAR du VIH-1 constitue une cible privilégiée. Au cours de ce travail, nous avons développé deux stratégies en vue de cibler et d’inhiber les fonctions biologiques de l’ARN TAR. Une première stratégie a consisté à élaborer des PNA cycliques « antisens » (Peptide Nucleic Acids : analogues d’ARN/ADN), susceptibles d’établir un complexe très stable et spécifique avec la boucle de l’ARN TAR. La seconde stratégie a consisté en l’élaboration d’un conjugué d’arginine et de PNA, ciblant simultanément le renflement et la boucle de l’ARN TAR. Dans une premier temps, nous avons donc mis au point la synthèse, en phase solide, de ces différentes molécules. Puis leur interaction avec l’ARN TAR a été évaluée par dénaturation thermique, suivie par spectroscopie UV. Ces études ont montré que les PNA cycliques forment un complexe très stable et spécifique avec l’ARN TAR. De même, une interaction entre le conjugué d’arginine et de PNA et l’ARN TAR a été mise en évidence.