thesis

Approche moléculaire des cancers bronchiques

Defense date:

Jan. 1, 2002

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Directors:

Abstract EN:

Lung cancer is the leading cause of cancer death in the world. We chosen to realize the molecular characterization of different histological types of lung cancer and the detection of tumor plasma DNA. In a first part, we showed by allelotyping that a panel of 7 markers could characterize 87% of adenocarcinomas, revealing that alteration at 17q23 locus should be a good prognosis marker, and showed significant associations between alteration at locus 9p21 and 3p24 or 9q34. Allelotyping of plasma DNA with an enlarged panel of 12 microsatellites in a cohort of 34 lung cancer patients, could characterize 88% of the patients with a specificity of 100%. Shorter panel of markers could be informative for histological type. Furthermore, plasma DNA alteration of chromosome 9 appeared to be correlated with a poorer survival. Simultaneous alteration of one or the other allele in paired samples resulting from independent events, suggested a clonal tumor heterogeneity. We verified this hypothesis in a cohort of colorectal cancer with paired liver metastasis using a panel of 33 markers. Such alternative alterations could be seen at most of the chromosomes, regions of which could contain oncogenes. Furthermore, we have characterized squamous and adenocarcinoma by studying of loci containing some of genes belonging to FGFR/FGF and c-Met/HGF families involved in lung morphogenesis. Different patterns of alterations appeared between these two groups, particularly including 15q13-22 locus containing FGF7. Then, our study underlines new patterns of molecular alterations in lung carcinogenesis by histological sub-type, and allows us to propose a sensitive test for the detection of lung tumor cells, which could be useful for the follow-up of lung cancer patients.

Abstract FR:

Le cancer bronchique est la première cause de décès par cancer dans le monde. Nous nous sommes intéressés à la caractérisation moléculaire des différents types histologiques de ce cancer ainsi qu'à la détection de l'ADN plasmatique tumoral. Nous avons pu montrer qu'un panel de 7 microsatellites caractérisait 87% d'une population d'adénocarcinomes avec une association préférentielle d'altérations entre les régions 9p21 et 3p24 ou 9q34, et que l'altération de la région 17q23 serait un marqueur de bon pronostic. L'allélotypage de l'ADN plasmatique de 34 patients avec 12 marqueurs a permis de caractériser la présence d'ADN tumoral chez 88% des patients avec une spécificité de 100%. La présence d'altération de l'ADN plasmatique au niveau du chromosome 9 serait de moins bon pronostic. Des panels restreints de microsatellites seraient informatifs d'un type histologique. La détection de l'altération simultanée de l'un ou l'autre allèle dans des prélèvements appariés résultant d'événements indépendants, révèlerait une hétérogénéité clonale des tumeurs bronchiques. Nous avons vérifié que cette hypothèse pourrait être plus générale en étudiant une population de carcinomes colo-rectaux avec un panel de 33 microsatellites. Ces altérations alternatives s'observent sur de nombreux chromosomes, et pourraient identifier de nouvelles régions oncogéniques. Afin de mieux préciser l'origine des sous-types histologiques, nous avons caractérisé des carcinomes épidermoides et des adénocarcinomes par l'étude de loci contenant certains des gènes de la famille des FGFR/FGF et de c-Met/HGF impliqués dans la morphogénèse broncho-pulmonaire. Nous avons identifié des groupes d'altérations différents entre ces deux sous-types, impliquant notamment le locus 15q13-22 contenant FGF7. L'ensemble de ce travail nous a permis d'approfondir les bases moléculaires de la cancérogenèse bronchique et de proposer un test sensible de détection de cellules tumorales bronchiques applicable au suivi des patients