Duplications dans le génome de Saccharomyces cerevisiae : Sélections,caractérisation et mécanismes
Institution:
Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008)Disciplines:
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La duplication des séquences d'ADN contribue à la plasticité des génomes et représente un des moteurs de l'évolution. Ces dernières années, le séquençage systématique de plusieurs organismes montre l'importance quantitative des régions dupliquées au sein des génomes. Cependant, l'analyse de ces séquences n'a pas permis d'élucider les mécanismes impliqués dans la genèse de tels événements. Au laboratoire, un système expérimental basé sur l'utilisation de l'allèle mutant du gène URA2 a permis de sélectionner positivement des duplications d'ADN chez S. Cerevisiae. Afin de caractériser les duplications et de comprendre les mécanismes impliqués, une analyse moléculaire fine de 2 collections de révertants (haploïdes et diploïdes) porteurs d'une duplication a été réalisée. L'analyse des révertants haploïdes a permis de mettre en évidence deux processus par lesquels une séquence d'ADN peut se dupliquer : la duplication génique et la duplication segmentale. Les duplications géniques sont issues d'un processus de rétroposition c'est-à-dire de la formation d'un ADNc suite à la transcription inverse de l'ARNm correspondant suivie de son intégration dans le génome. Les duplications segmentales sont des régions dupliquées en tandem direct de taille comprise entre 5 et 90 kb. Le mécanisme impliqué dans leur formation correspond probablement à une erreur lors de la réplication. L'analyse des révertants diploïdes a permis de mettre en évidence deux autres moyens par lesquels une séquence d'ADN peut se dupliquer : l'aneuploïdie et la translocation non-réciproque. Ces deux types de remaniements conduisent à la formation d'un chromosome chimère obtenu probablement par un mécanisme de type BIR (break-induced replication). Cette étude apporte une preuve expérimentale sur la pluralité des moyens et des mécanismes permettant à une même séquence de se dupliquer. De plus, elle souligne l'importance de la ploïdie dans la sélection de tels remaniements.