thesis

Synthèse de dérivés mono- et bis-acridyl d'une bis(arginyl) porphyrine : étude de la nature et de la sélectivité de leurs interactions avec des acides nucléiques et des oligonucléotides double brin

Defense date:

Jan. 1, 2002

Edit

Institution:

Paris 11

Disciplines:

Chemistry

Authors:

Directors:

Abstract EN:

There is much interest in finding molecules that can bind specifically to oncogenic and/or retroviral DNA sequences. These molecules could interfere with regulatory proteins and inhibit their activity. For this purpose, a bis(arginyl)porphyrin has been designed by molecular modelling and synthesised in order to target the palindromic sequence GGCGCC which is part of the Primer Binding Site (PBS) of the Long Terminal Repeat (LTR) of the HIV-1 retrovirus. Study of the interaction of BAP with oligonucleotides has revealed its preferential binding to d(GGCGCC)2 by intercalation of the pophyrin core into the central d(CpG)2 step and binding of the two arginine arms to the two guanines upstream from the intercalation site in the major groove. In order to increase the binding affinity and the selectivity of BAP for the PBS sequence, mono- and bis-acridyl conjugates have been designed by molecular modelling and their synthesis has been achieved. . .

Abstract FR:

Cette thèse s'inscrit dans la recherche de molécules susceptibles d'interagir spécifiquement avec des fragments de gènes impliqués dans la réplication ou la transcription d'ADN viral ou oncogène. Ces molécules pourraient inhiber l'expression de ces gènes en interférant avec la fixation des protéines régulatrices. Dans cette optique, une bis(arginyl)porphyrine (BAP) a été conçue par modélisation moléculaire et synthétisée afin de cibler la séquence GGCGCC du Primer Binding Site (PBS) du Long Terminal Repeat (LTR) du rétrovirus VIH-1. L'étude de l'interaction de la BAP avec des oligonucléotides a montré sa fixation préférentielle sur la séquence d(GGCGCC)2 par intercalation du noyau porphyrine dans le site d(CpG)2 central et interaction dans le grand sillon des deux arginines avec les deux guanines situées en amont du site d'intercalation. . .