Recherche de protéines utilisant des systèmes d’import alternatifs pour leur adressage vers les chloroplastes
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Abstract EN:
One important mechanism that participates in the regulation of accumulation of plastid proteins is the protein targeting that allows import of thousands of nuclear encoded proteins to the chloroplast. Recent studies have revealed intriguing arrays of alternative or noncanonical chloroplast import pathways. In this context, the aim of this study was to identify other plastid proteins trafficking through these alternative targeting pathways and to understand the mechanisms that control these pathways. Two complementary approaches have been initiated. The first one was based on specific glycoprotein isolation methods. The second strategy was based on a systematic proteomic analysis, targeted to Arabidopsis subplastidial fractions, and followed by in silico identification of proteins containing noncanonical targeting sequences. Subcellular localization analyses of selected proteins reveal that some of these proteins are targeted to chloroplasts while lacking any classical N-terminal signal.
Abstract FR:
L’endosymbiose à l’origine de l’acquisition des plastes par les cellules végétales s’est accompagné d’un transfert de gènes du génome de l’endosymbiote vers le génome nucléaire de l’hôte. Cet évènement a conduit à la mise en place de systèmes d’adressage et d’import des protéines chloroplastiques. De récentes études mettent en lumière l’existence de nouvelles voies d’adressage des protéines vers les chloroplastes. Dans ce contexte, ce travail de thèse avait pour but l’identification d’autres protéines empruntant des voies alternatives d’adressage chloroplastique. Pour ce faire, deux stratégies ont été retenues. La première était basée sur des méthodologies de capture spécifiques des N-glycoprotéines. La seconde stratégie était basée sur l’analyse protéomique des fractions chloroplastiques suivie de la recherche de protéines candidates par analyse in silico. L’analyse de la localisation subcellulaire des protéines sélectionnées révèle une localisation chloroplastique pour trois protéines.