thesis

Nuclear architecture in normal and cloned bovine early embryos : dynamics of heterochromatin

Defense date:

Jan. 1, 2008

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Abstract EN:

La reprogrammation au cours de la fécondation et du développement pré-implantatoire de l’embryon fécondé in vitro (IVF) chez les mammifères est un processus complexe qui permet le retour à un état indifférencié des cellules hautement spécialisées que sont les gamètes lors de la syngamie, puis leur différenciation progressive en différent lignages cellulaires dans l’embryon. Ces processus comprennent des changements dans la structure de la chromatine, dans les modifications épigénétiques et dans l’architecture nucléaire des noyaux embryonnaires. L’objectif de cette étude était de mettre en place des approches pour la compréhension de ces processus dans les embryons précoces. Nous avons tiré parti de la comparaison entre embryons normaux (IVF) et issus de transfert de noyau (NT) dans l’espèce bovine où le développement pré-implantatoire s’étant sur une période suffisamment longue pour caractériser la dynamique des événements de reprogrammation nucléaire avant la mise en route de l’activation majeure du génome embryonnaire. Dans une première approche, nous avons étudié la mise en place de l’hétérochromatine spécifique à l’embryon au cours de la période de reprogrammation dans les embryons bovins issus de fécondation et de NT. Nous avons utilisé deux marqueurs de l’hétérochromatine péricentrique : la protéine hétérochromatine 1 (HP1-beta) et l’histone H3 tri-méthylée (H3K9me3) ; et un marqueur des centromères (CENP A/B), de façon à caractériser les paramètres structuraux de l’hétérochromatine constitutive dans les premiers stades de développement embryonnaire. En utilisant des techniques d’immunofluorescence, nous avons pu observer les changements dynamiques dans l’organisation de l’hétrochromatine en relation avec l’origine des embryons. Dans les embryons IVF et une partie des embryons NT, l’hétérochromatine apparaît dans un état dispersé, et ceci jusqu’au stade 8-cellule ; puis sous une forme condensée qui correspond à l’association bien caractéristique de blocs d’hétérochromatine et d’H3K9me3 avec les centromères, connues sous le nom de chromocentres. Cependant, une partie significative des embryons NT montrent une altération de la dynamique d’hétérochromatinisation révélée par une condensation précoce, dès le stade 2-cellule, de HP1 et H3K9-me3. Dans une seconde approche, nous avons utilisé des cellules somatiques au stade de la sénescence comm cellules donneuses de noyau de façon à tester l’influence de l’organisation structurale du noyau donneur sur l’organisation structurale des noyaux dans les embryons clonés. Les arrangements tridimensionnels à large échelle de l’hétérochromatine dans les noyaux sénescents NT récapitulent la dynamique observée dans les embryons IVF ou NT issus de noyau de cellules non sénescentes. Notamment, les pourcentages d’embryons avec une hétérochromatine dispersée ou condensée prématurément sont comparables avec les études précédentes. Ces résultats suggèrent l’existence d’un processus de reprogrammation épigénétique robuste piloté par l’ovocyte dans les embryons précoces de bovins. Les cinétiques de restructuration du génome altérées dans une partie des embryons NT pourraient être liées à l’activation précoce de la transcription et l’augmentation du taux de méthylation qui ont été rapportées dans d’autres études. Le présent travail nous a permis de mettre en évidence une distinction entre des embryons NT avec une reprogrammation normale et des embryons NT avec une anomalie, au moins temporelle, de la reprogrammtion épigénétique. Egalement, nous avons démontré que l’impact de l’organisation nucléaire de la cellule donneuse au niveau de l’hétérochromatine sur l’organisation structurale du noyau dans l’embryon NT est relativement modéré.

Abstract FR:

Developmental reprogramming during mammalian fertilization and pre-implantation development in in vitro fertilized (IVF) embryos is a complex process that allows the highly differentiated gametes to revert to undifferentiated cell types following syngamy and then gradually differentiate into individual cell lineages. These processes involve changes in chromatin structure, in global epigenetic modifications and in nuclear architecture of embryonic nuclei. The objective of the present study was to develop approaches for understanding these series of phenomena in early embryos. We used the possibility to compare normal (IVF) and nuclear tranfer (NT) embryos in bovine species where the pre-implantation development is long enough to assess the nuclear dynamics of reprogramming events before major embryonic genome activation. In a first approach, we studied the establishment of heterochromatin pattern specific for embryo during the reprogramming period in IVF and NT bovine embryos. We applied two markers of pericentric heterochromatin: heterochromatin protein 1 (HP1beta) and tri methylated histone H3 (H3K9me3); and a marker of centromeres (CENPA/B), in order to characterize structural parameters of constitutive heterochromatin in early stages of development. Using immunofluorescence technique, we were able to observe dynamic changes in heterochromatin organization in connection with embryos origin. In IVF and some NT embryos, heterochromatin was observed in dispersed state up to the 8-cell stage, and then in a condensed pattern corresponding to the well characterized chromocenters constituted by blocks of HP1beta and H3K9me3 associated with centromeres. However, a significant part of NT embryos underwent an altered dynamics of heterochromatinization characterized by a precocious heterochromatin condensation as soon as the 2-cell stage. In a second approach, we used senescent somatic cells as donors for nuclear transfer experiments in order to assess the influence of structural organization of donor cell nucleus on structural organization of nuclei in cloned embryos. Surprisingly, the large-scale three-dimensional arrangement of heterochromatin within the senescent-NT nucleus recapitulated the dynamics observed in IVF or somatic non-senescent NT embryos, with comparable percentages of embryos with dispersed and precociously condensed heterochromatin similar to those observed in the previous investigation. These results suggest that a robust process of epigenetic reprogramming is piloted by bovine oocyte in early embryos. The altered kinetics in genome restructuring in some NT embryos might be linked to the precocious transcriptional activation and precocious increase of DNA methylation level reported in other studies. The present work allowed us to point out the distinction between NT embryos with correct developmental reprogramming and abnormal, at least temporally, epigenetic reprogramming, as well as to demonstrate that the impact of nuclear organization of heterochromatin in the donor cell on structural organization of nucleus in NT embryos is relatively low. This may account for the relatively high development efficiency in bovine cloning as compared to other species.