Etude de la structure et de la dynamique interne de la parvalbumine de brochet par résonance magnétique nucléaire du carbone 13 en abondance naturelle
Institution:
Montpellier 2Disciplines:
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Abstract FR:
La parvalbumine de brochet est une proteine globulaire de 11. 5 kda qui possede des structures de type main-ef liant le calcium. L'attribution quasi complete des resonances des carbones 13 protones a ete effectuee grace a des experiences heteronucleaires bidimensionnelles. L'analyse des deplacements chimiques des carbones alpha a montre que ceux-ci peuvent etre tres sensibles a des aspects conformationnels localises. Afin de caracteriser la dynamique interne du squelette de la parvalbumine, les parametres de relaxation r1 et r2 et les effets overhauser nucleaire 1h-13c ont ete mesures pour 69 carbones alpha en abondance isotopique naturelle avec un spectrometre operant a 600 mhz. L'interpretation des donnees de relaxation a ete faite par une approche double associant l'analyse de lipari-szabo et la determination directe des valeurs de la fonction de densite spectrale du mouvement. Les resultats suggerent que la forme calcique de la parvalbumine est globalement rigide, y compris les boucles fonctionnelles liant le calcium. De plus, il a ete trouve que les profils des valeurs de densite spectrale sont plus sensibles a la structure secondaire que les parametres d'ordre s2. De meme, ces profils revelent des mouvements differents suivant la frequence d'observation