Impact de la capacité nécrogène sur la valeur adaptative du virus Y de la pomme de terre
Institution:
Rennes, Agrocampus OuestDisciplines:
Directors:
Abstract EN:
Potato virus Y (PVY, genus Potyvirus) is transmitted by aphids in a non persistent manner. This constituted by an increasing proportion of the especially damaging necrotic isolates (PVYN). To improve sanitary selection procedures, a new tool allowing the detection and characterisation of PVY genotypes has been developed. For the first time, this tool, based on SNaPshot technology, targelets molecular determinants involved in PVY necrotic ability (polymorphisms A/G2213 and A/C2271). This innovative tool i) allows the characterisations of PVY isolates according to their ability to induce necrosis, ii) allows the characterisation of viral genomes in groups (PVYo, PVYN) and sub-groupes (PVY NTN, PVYN-W) in single or dual interactions and iii) has an especially low detection threshold (10 copies). For a better comprehension of the mechanisms which have led to the epidemiological observations, the impact of the necrotic ability of PVY fitness has been measured. Two isolates and three genotypes mutated at position 2213 and/or 2271 have been used. Experiments were performed during single and mixed infections, serial passages and aphid inoculations. Obtained results show i) a cost of necrosis property of fitness, ii) a serial passages and aphid inoculations. Obtained results show i) a cost of necrosis property on fitness, ii) a serial passages and aphid inoculations. Obtained results show i) a cost of necrosis property on fitness, ii) a major role ov viral genetic background, PVYN-605 genome being associated to a higher competitiveness than major role of viral genetic background, PVY N-605 genome being associated to a higher competitiveness than PVYo-139, iii) interactions between nucleotides 2213 and 2271, and viral genetic background, iv) host dependant compensatory effects between these two factors.
Abstract FR:
Le virus Y de la pomme de terre (PVY, genre Potyvirus), transmis par puceron selon le mode non persistant, est l’un des virus les plus dommageables sur pomme de terre. Les populations naturelles de PVY ont récemment évolué et contiennent une proportion croissante d’isolats nécrogènes (PVYN) particulièrement dommageables. Afin d’améliorer les procédures de contrôle sanitaire, un nouvel outil de détection et de caractérisation des génotypes de PVY a été développé. Pour la première fois, cet outil basé sur la technique SNaPshot, cible des déterminants moléculaires liés à la capacité nécrogène du PVY (Polymorphismes A/G2213 et AC2271) Cet outil innovant i) assure la caractérisation des isolats de PVY sur la base de leur capacité à induire des nécroses, ii) permet la caractérisation des génomes viraux en groupes (PVYo, PVYN) comme en sous-groupes (PVYNTN, PVYN –W) en infection simple ou double et iii) est associé à un seuil de détection particulièrement bas de 10 copies. Afin de comprendre les données épidémiologiques observées, l’impact de l’acquisiation de la capacité nécrogène sur la valeur adaptative du virus a été mesurée. Des isolats naturels ainsi que trois génotypes mutés aux positions 2213 et/ou 2271, ont été utilisés. Cette étude a été conduite au cours d’infections simples, de compétitions entre génotypes viraux, de passages en séries et de transmissions aphidiennes. Les résultats acquis lors de ces expérimentations mettent en évidence i) une plus faible valeur adaptative associée à la capacité nécrogène, ii) un effet fort du fond génétique viral, le génome de l’isolat PVYN-605 étant associé à une plus forte compétitivité que celui de PVYo-139, iii) l’existence d’interactions entre nucléotiques 2213 et 2271 et le fond génétique viral, iv) des effets de compensation hôte dépendants entre les impacts de ces deux facteurs.