Impact de la nutrition et des bactéries Escherichia coli adhérentes et invasives associées à la maladie de Crohn sur les marques épigénétiques et l'expression des gènes
Institution:
Université Clermont Auvergne (2017-2020)Disciplines:
Directors:
Abstract EN:
Crohn’s Disease (CD) is an inflammatory bowel disease with a complex etiology including genetic, infectious, environmental and epigenetic factors. Modifications of DNA methylation profiles, and methyl donor molecules (folate and B12 vitamin) deficiencies have been observed in CD patients. The aim of this study was to investigate the impact of a high methyl diet (HMD), enriched in methyl donor group molecules involved in DNA methylation metabolism (folate and B12 vitamin), on intestinal physiology and gene expression. In this study, we showed that HMD favors bacterial species having beneficial effects on gut physiology. Furthermore, this diet modifies DNA methylation level and expression of various genes. An increase in DNA methylation was observed on the CEACAM6 gene promotor (involved in adherent and invasive Escherichia coli (AIEC) adhesion in CD patients) leading to a decrease of its expression. In conclusion, this work suggests that a methyl donor group supplementation could modulate microbiota composition and expression of genes involved in development and maintenance of inflammation in CD.
Abstract FR:
La maladie de Crohn (MC) est une maladie inflammatoire chronique de l’intestin dont l’étiologie complexe comprend des facteurs génétiques, infectieux, environnementaux ainsi qu’une composante épigénétique. Il a été montré des profils de méthylation de l’ADN modifiés chez les patients MC ainsi que des carences en molécules donneuses de groupements méthyles (folate et vitamine B12). L’objectif de ce projet était d’étudier l’impact d’un régime alimentaire enrichi en molécules donneuses de groupements méthyles (HMD), participant au métabolisme de la méthylation de l’ADN, sur la physiologie intestinale et l’expression des gènes. Nous avons montré qu’un régime HMD favorise le développement de certaines populations bactériennes ayant des effets bénéfiques sur la physiologie intestinale. De plus, ce régime modifie les niveaux de méthylation de l’ADN et l’expression de nombreux gènes. En particulier, l’augmentation du niveau de méthylation du promoteur du gène CEACAM6 (impliqué dans l’adhésion des Escherichia coli adhérents et invasifs (AIEC) chez les patients MC) ainsi qu’une diminution de son expression ont été observées. En conclusion, une supplémentation en molécules donneuses de méthyles pourrait permettre de réguler la composition du microbiote intestinal et l’expression de gènes participant au déclenchement et au maintien de l’inflammation intestinale dans la MC.