Quantification du niveau de contamination de Campylobacter jejuni dans la filière volaille - Influence de la variabilité des souches et de l'histoire cellulaire
Institution:
Nantes, Ecole nationale vétérinaireDisciplines:
Directors:
Abstract EN:
Campylobacter jejuni is the leading cause of human enteritis of bacterial origin worldwide and poultry is the main vector of contamination. The main objective of this study was to assess the effect of the slaughter poultry process on the behaviour of C. jejuni on the subsequent stress, taking into account strain variability and the influence of cell history. Some key steps of the slaughter process that generate hot and cold stress were mimicked in the laboratory. The influence of cell history on the inactivation of C. jejuni during the subsequent step of cold storage was hypothesized. The contamination level of Campy/obacter on chicken at the consumer's place was estimated and the results complied with the performance objective defined by the ICMSF. lt was also confirmed that cell history had an impact on the behaviour of C. jejuni. The molecular mechanisms underlying the cell history were investigated by RT-qPCR applied to 3 strains, with the aim of determining 11biomarker11 genes. The expression of these biomarkers could predict the subsequent behaviour of the pathogen. Using PLS regression, a predictive model was built for only one of the three strains of C. jejuni, resulting in the identification of 9 biomarker genes. The construction of a generalized model based on the quantification of biomarker gene expression, will require the exploration of new methodologies. This could pave the way for new generation risk assessment models.
Abstract FR:
Campylobacter jejuni est la principale cause d'entérites humaines d'origine bactérienne dans le monde et la volaille est le principal vecteur de contamination. L'objectif principal de cette étude était d'évaluer l'effet du processus d'abattage des volailles sur le comportement de C. jejuni à un stress ultérieur, en tenant compte de la variabilité des souches et de l'influence de l'histoire cellulaire. Certaines étapes clés du processus d'abattage générant un stress chaud et froid ont été reproduites au laboratoire. L'hypothèse était que cette histoire cellulaire pouvait influencer l'inactivation de C. jejuni pendant l'étape ultérieure de stockage au froid. Le niveau de contamination du poulet en Campylobacter chez le consommateur a été estimé et les résultats obtenus satisfont l'objectif de performance définis par l'ICMSF. 11 a été aussi confirmé que l'histoire cellulaire avait un impact sur le comportement de C. jejuni. Les mécanismes moléculaires sous-jacents à l'histoire cellulaire ont été investigués par RT-qPCR appliquée à 3 souches, dans l'objectif de déterminer des gènes «biomarqueurs». L'expression de ces biomarqueurs permettraient de prédire le comportement ultérieur du pathogène. Utilisant la régression PLS, un modèle prédictif a été bati pour une seule des trois souches de C. jejuni, aboutissant à l'identification de 9 gènes biomarqueurs. La construction d'un modèle généralisable à l'ensemble des souches, basé sur la quantification de l'expression de gènes biomarqueurs, nécessitera d'explorer de nouvelles pistes méthodologiques. Ceci pourrait ouvrir la voie vers une nouvelle génération de modèles d'appréciation du risque.