Etude des mécanismes de l'extrême tolérance aux radiations de la bactérie Deinococcus deserti par une approche de génomique fonctionnelle
Institution:
Aix-Marseille 2Disciplines:
Directors:
Abstract EN:
The genome of Deinococcus deserti, a highly radiation-tolerant bacterium, was analyzed and compared to those of D. Radiodurans and D. Geothermalis. About 230 proteins are specifically conserved in these 3 species, including IrrE, a regulator protein essential for radiotolerance. D. Deserti has several supplementary DNA repair genes, like imuY and dnaE2 (translesion DNA polymerases). Moreover, D. Deserti has 3 recA that code for 2 different RecA proteins (RecAC et RecAP). To study these genes, genetic tools were developed for D. Deserti. Different results suggest that IrrE, required for the induction of several genes after irradiation, has peptidase activity. The 2 RecA proteins are functional for DNA repair. D. Deserti is mutable by UV, which requires ImuY, DnaE2 and RecAC, but not RecAP
Abstract FR:
Le génome de Deinococcus deserti, une bactérie très radiotolérante, a été analysé et comparé à ceux de D. Radiodurans et D. Geothermalis. Environ 230 protéines sont spécifiquement conservées chez ces 3 espèces, dont IrrE, un régulateur essentiel pour la radiotolérance. D. Deserti possède plusieurs gènes supplémentaires liés à la réparation de l’ADN, dont imuY et dnaE2 (ADN polymérases translesionnelles). En plus, D. Deserti a 3 recA qui codent pour 2 protéines RecA différentes (RecAC et RecAP). Pour étudier ces gènes, des outils génétiques ont été mis au point. Différents résultats suggèrent qu’IrrE, nécessaire pour l’induction de plusieurs gènes après irradiation, a une activité peptidase. Les 2 RecA sont fonctionnelles pour la réparation de l’ADN. D. Deserti est mutable par UV, ce qui nécessite ImuY, DnaE2 et RecAC, mais pas RecAP