Détection de bactéries par sondes nucléiques : application au diagnostic de salmonelles, de clavibacter michiganensis et de pseudomonas syringae pathovar tomato
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Des sondes nucléiques spécifiques de bactéries ont été recherchées à partir de régions variables de l'ARNR 16s et l'ADNR, et des techniques rapides de diagnostic utilisant ces sondes ont été mises au point. Ces méthodes ont été appliquées, dans le cadre de projets industriels, au dépistage des salmonelles, des clavibacter michiganensis et du pseudomona syringae pathovar tomato. Les travaux sur salmonelles ont permis de mettre au point d'une technique de recherche systématique de sondes nucléiques spécifiques, à partir des régions variables définies, applicables à tous les micro-organismes, en dehors des virus. Ils ont aussi permis de tester différentes méthodologies de détection par hybridation sur membrane, à l'aide de sondes marquées radioactivement ou non. Bases sur ces résultats, les travaux portant sur le dépistage des deux autres bactéries ont ensuite abouti à la mise au point d'un test de diagnostic par PCR, spécifique, sensible et rapide de ces deux bactéries.