Caracterisation moleculaire, diversite genetique et controle du virus de la mosaique de l'igname (ymv)
Institution:
École nationale supérieure agronomique (Montpellier)Disciplines:
Directors:
Abstract EN:
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Abstract FR:
Le virus de la mosaique de l'igname (yam mosaic virus, ymv) est un membre du genre potyvirus, de la famille potyviridae. Dans le cadre d'un programme de controle des potyvirus dans l'igname, nous avons determine la sequence nucleotidique de l'isolat ymv-112 originaire de cote d'ivoire, apres clonage et sequencage complet du genome viral. L'analyse de la sequence a montre qu'il s'agissait d'une nouvelle espece du genre potyvirus. Nous avons ensuite analyse le polymorphisme de sequence pour plusieurs isolats de ymv, dans cinq regions variables ou conservees du genome des potyvirus. La premiere proteine (p1) et le n-terminal de la proteine de capside (cp) apparaissent comme les regions les plus variables du genome du ymv. Puis, nous avons quantifie la variabilite genetique existant pour chaque proteine du genome des potyvirus. Nous avons ainsi aligne toutes les sequences disponibles de potyvirus, genere des dendrogrammes et produit des distributions de frequence de chaque pourcentage de similarite caracterisant deux sequences. Pour chacune des proteines, une distribution multimodale a ete obtenue qui distingue genres, especes, sous-especes et souches des membres de la famille potyviridae. Enfin, cinq constructions chimeriques derivees du gene de la cp du ymv-112 ont ete realisees pour transformer des plantes de nicotiana benthamiana. Une resistance au ymv-112 et a un autre isolat de ymv a ete mise en evidence pour plusieurs lignees r1 exprimant la cp alors qu'une seule lignee r1 transformee avec la sequence codant pour la cp fusionnee a la replicase tronquee a presente une resistance specifique au ymv-112