thesis

Les transferts de genes entre especes de cafeiers diploides : etude des hybrides f1 et bc1 entre c. pseudozanguebariae bridson et c. liberica bull ex. hiern (c. dewevrei de wild et th dur)

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Jan. 1, 1997

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Cette etude a pour objet l'evaluation des possibilites de transferts de genes entre deux especes de cafeiers diploides (2n = 2x = 22) phylogenetiquement eloignes : coffea pseudozanguebariae (pse) originaire du kenya et de tanzanie et c. Liberica-dewevrei (dew) originaire d'afrique centrale. Les recombinaisons ont ete etudiees d'une part a l'aide de l'hybridation genomique in situ (hgis) et de la cytometrie en flux et d'autre part a l'aide de marqueurs moleculaires (rflp). De plus, l'heritabilite de la teneur en cafeine, presente chez dew et absente chez pse, a ete etudiee ainsi que la recherche de marqueurs lies a ce caractere. Les hybrides de deuxieme generation ont ete obtenus par fecondation libre des hybrides f1. Les marqueurs rflp associes a des donnees phenotypiques ont permis de caracteriser ces hybrides : 18 proviendraient de backcross sur l'espece pse et 65 proviendraient de backcross sur l'espece dew. L'hgis a permis de determiner la composition genomique d'hybrides f1 et de 7 hybrides de deuxieme generation choisis pour representer la variabilite de la quantite d'adn par noyau entre les parents (2c = 1,13 pg pour pse et 2c = 1,43 pg pour dew). Une relation lineaire a ete mise en evidence entre la taille du genome et le nombre de chromosomes de pse. L'etude de la quantite d'adn par noyau dans les deux backcross et des proportions d'alleles dew a 10 locus rflp independants suggerent que les chromosomes des deux genomes s'associeraient de maniere aleatoire. Une seule carte genetique a ete publiee chez les cafeiers sur c. Canephora ; elle comprend 15 groupes de liaison et une quarantaine de marqueurs rflp. La cartographie de 15 marqueurs rflp sur le croisement pse x dew a mis en evidence deux groupes de liaison et 9 locus independants. La cartographie comparee avec c. Canephora pour deux segments de chromosomes independants indique des taux de recombinaisons equivalents. L'etude de la teneur en cafeine montre qu'elle est sous controle polygenique, avec un fort effet genetique. Cependant, le caractere presence versus absence de cafeine serait controle par un gene majeur avec la presence dominant l'absence. Ce gene explique 41% des variations observees dans le backcross sur pse. La recherche de marqueurs lies a des qtls de la teneur en cafeine a ete realisee dans le backcross sur dew ne comprenant que des individus contenant de la cafeine. Le locus g13 explique 20% des variations de la teneur en cafeine. Ce locus est aussi lie a la duree du cycle de fructification (41% de variance expliquee) : les fortes teneurs en cafeine sont associees a de longs cycles. Ces resultats preliminaires sont encourageants pour le transfert de l'absence de cafeine de pse vers des especes de cafeiers en contenant. En effet, ce caractere semble etre determine par un gene majeur et nous n'avons detecte aucun frein aux recombinaisons.