Etude structurale de l'antithrombine iii d'origine bovine
Institution:
Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008)Disciplines:
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L'antithrombine iii est le principal inhibiteur de la thrombine dans la cascade de coagulation. Son action est fortement acceleree par la fixation d'un polysaccharide, l'heparine. L'antithrombine iii d'origine bovine a ete cristallisee. Les cristaux appartiennent au groupe d'espace tetragonal, caracterise par les parametres de maille a et b de 91. 3 angstroms, c egal a 383. 1 angstroms, et les angles alpha, beta, gamma de 90 degres. Sa structure tridimensionnelle a ete determinee par radiocristallographie des rayons x a 3. 2 angstroms de resolution. Les donnees de diffraction ont ete enregistrees sur films a l'aide du rayonnement synchrotron. Le probleme de la phase a ete resolu par les methodes du remplacement moleculaire et du remplacement isomorphe unique. La qualite de la carte de densite electronique a ete sensiblement amelioree par les procedures de modification de densite dans l'espace reel. L'affinement de la structure par mecanique et dynamique moleculaire a conduit a un facteur d'accord cristallographique de 21 pour cent. L'examen de la structure permet de decrire le site de fixation de l'heparine