thesis

Influence de l'immobilisation sur le protéome d'Escherichia coli K-12. Incidence sur la résistance à un choc hypothermique

Defense date:

Jan. 1, 2000

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Institution:

Rouen

Disciplines:

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Abstract FR:

L'influence de l'état immobilisé sur la résistance d'Escherichia coli, bactérie mésophile, à un stress hypothermique a été étudiée en utilisant une structure modèle de biofilm (immobilisation de cellules viables d'E. Coli dans un gel d'agar plan puis incubation de ce dernier dans un milieu minimal). Nous avons montré, dans un premier temps, que ces cellules immobilisées présentent une résistance accrue à un choc froid par rapport à ces mêmes cellules cultivées en suspension. Dans un second temps, nous avons démontré, par une approche protéomique, que l'immobilisation induit de profondes modifications au niveau de l'expression protéique d'E. Coli. Trente-cinq protéines voient leur quantité relative augmenter de manière spécifique chez les cellules immobilisées, alors que la quantité relative de 59 polypeptides diminue chez ces mêmes cellules. Cinq protéines dont la quantité varie spécifiquement chez les bactéries piégées ont été identifiées après microséquençage. Les cellules d'E. Coli immobilisées accumulent l'aldéhyde déshydrogénase (Alda), la Single-Strand-Binding protéine (SSB) et la dipeptide perméase (DppA). Ces mêmes cellules sous-expriment la protéine YFID et une protéine de phase stationnaire capable de se lier à l'ADN (Dps). Enfin, nous avons mis en évidence qu'à la suite d'un choc hypothermique, les cellules immobilisées présentent une réponse protéique différente de celle observée chez les cellules cultivées en suspension. Ces différences pourraient expliquer la forte résistance des cellules immobilisées face au choc froid