Etude du genome d'encephalitozoon cuniculi (microspora), principalement par une approche de sequencage systematique du chromosome i
Institution:
Clermont-Ferrand 2Disciplines:
Directors:
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Abstract FR:
Parasites intracellulaires obligatoires responsables de diverses pathologies animales et humaines, les microsporidies sont des eucaryotes unicellulaires amitochondriaux dont le genome haploide peut etre aussi petit que chez certains procaryotes. Afin d'acquerir des informations sur l'organisation genomique et les fonctions geniques de ces parasites, nous avons entrepris le sequencage systematique du plus petit chromosome (217 kb) d'encephalitozoon cuniculi, espece dont le genome haploide est seulement de 2,9 mb. Apres fragmentation aleatoire de l'adn et clonage, il a ete obtenu un ensemble de contigus representant environ 180 kb du chromosome i. Actuellement, nous avons identifie des sequences repetees de type micro- et minisatellite et 31 genes incluant l'adnr complet et 22 genes codant pour des proteines connues chez d'autres organismes. Ces genes font prevoir diverses potentialites metaboliques pour les microsporidies : metabolismes de groupes monocarbones, du trehalose, synthese de chitine, controle transcriptionnel, maturation d'arnr de la comparaison des regions promotrices, il ressort deux sequences consensus (boite a : tatawa#-#2#0 et boite b : saaaat#-#4#0) qui pourraient etre impliquees dans l'initiation de la transcription. Plusieurs genes presentent au moins une sequence complementaire d'une partie 3 de l'arnr 16s qui, comme chez les procaryotes, interviennent dans l'initiation de la traduction (sequences de type shine-dalgarno et downstream box ). Des experiences de fusion du promoteur du gene d'aminopeptidase d'e. Cuniculi avec le gene lacz d'escherichia coli etayent l'hypothese d'un controle du demarrage de la traduction similaire a celui des bacteries. Notre analyse des contigs du chromosome i s'inscrit desormais dans le cadre d'un programme de sequencage systematique du genome complet d'e. Cuniculi, devant elargir la voie de la proteomique microsporidienne.