Contribution a l'etude structurale des aspartyl-arnt synthetases du monde procaryote
Institution:
Université Louis Pasteur (Strasbourg) (1971-2008)Disciplines:
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Abstract FR:
Les aminoacyl-arnt synthetases (aars) catalysent la fixation specifique d'un acide amine sur leurs acides ribonucleiques de transfert (arnt) selon une reaction en deux etapes. La premiere etape conduit, en presence des petits substrats (atp et acide amine) et de mg#2#+, a la formation d'un aminoacyl-adenylate. Cet intermediaire reactionnel reagit lors d'une deuxieme etape avec l'arnt pour donner un aminoacyl-arnt. Si les deux etapes de la reaction d'aminoacylation ont ete largement etudiees dans le systeme aspartique, il n'en est pas de meme pour la dynamique de la reconnaissance de l'arnt par sa synthetase. Deux complexes entre l'asprs de t. Thermophilus et son arnt homologue et entre l'arnt homologue d'e. Coli ont ete cristallises et leurs structures resolues. Dans les deux complexes, le bras accepteur des arnt est localise en dehors du site actif. L'arnt et la synthetase adoptent une conformation definissant un nouvel etat intermediaire. Ces deux structures comparees aux structures d'asprs resolues, montrent que des changements conformationnels de la proteine et de l'arnt sont necessaires a la formation du complexe (mouvements en bloc rigide du domaine n-terminal et du domaine additionnel, fermeture de l'angle de l'arnt). Ces deux complexes rendent compte de la fixation sequentielle de l'arnt sur l'enzyme (fixation de l'arnt au niveau du domaine n-terminal puis au niveau du site actif) sans que la fixation de l'arnt n'influe sur la conformation des boucles du site actif. Enfin, une etude des deux complexes en solution nous a permis de proposer un mecanisme de controle de l'entree du bras accepteur de l'arnt dans le site actif de l'enzyme par les petits substrats.