Etude physicochimique des interactions entre la proteine receptrice de l'amp cyclique d'escherichia coli (crp) et les acides nucleiques
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La crp est une proteine qui, en presence d'amp cyclique, se fixe au niveau de la region promoteur de certains operons bacteriens et stimule leur transcription. Le mecanisme moleculaire de cette activation n'est pas encore connu, mais la courbure de l'adn induite par la fixation de la proteine semble jouer un role important dans ce phenomene. Par des methodes physicochimiques telles que la titration en fluorescence et l'electrophorese de retardement, nous avons etudie l'interaction de cette proteine avec des fragments d'adn, d'un point de vue structural et thermodynamique. Nous nous sommes interesses a la fixation non specifique de la crp et nous avons caracterise cette interaction en termes de constante, de nombre de paires d'ions et de groupements protonables impliques. L'etude de l'effet de l'ampc sur cette fixation nous a permis de mettre en evidence que cet effecteur redistribue les interactions electrostatiques. L'etude de la fixation specifique de la crp sur differents sites nous a permis d'observer que l'affinite est d'autant plus importante que le site est symetrique. D'autre part, nous nous sommes interesses a l'aspect structural du complexe specifique crp-adn, en etudiant la fixation de la proteine sur un demi-site et sur un site portant une coupure simple brin en son centre. Cette etude nous permet de proposer que la courbure de l'adn induite par la crp se realise par des cassures locales qui ne sont pas situees au centre du site