Abstract FR:

L'objectif majeur de ce travail est l'etude, au sein d'aquiferes alluviaux, du transfert de nutriments et de contaminants en relation avec les parametres microbiologiques et faunistiques. Differents parametres abiotiques (e. G. Temperature, conductivite, ph, redox, oxygene, carbone organique dissous (cod) refractaire et biodegradable, nitrate, sulfate, phosphate, fer et manganese), microbiologiques (e. G. Abondance et activite bacteriennes, abondance en protozoaires) et faunistiques (e. G. Abondance, diversite taxonomique et fonctionnelle des invertebres) ont ete etudies. Bien que le choix de la methode d'echantillonnage soit un probleme majeur dans l'etude des aquiferes alluviaux, son impact sur la qualite des prelevements est encore peu documente. Aussi une etude comparative de differentes methodes d'echantillonnages (carottage vs pompage) a ete menee. Elle a permis de montrer qu'un prelevement par pompage donne une representation quantitative non biaisee des parametres physico-chimiques et bacteriologiques du milieu. La methode de pompage selectionnee (double packers adaptes sur une pompe peristaltique) semble offrir le meilleur compromis pour decrire l'aquifere profond en tenant compte de ses composantes physico-chimiques, microbiologiques et faunistiques. Cette methode a ete utilisee afin de determiner les parametres biotiques et abiotiques structurant les peuplements microbiens et faunistiques. Les experimentations ont ete conduites dans trois aquiferes alluviaux de la plaine du rhone, presentant des caracteristiques hydrogeologiques et des liaisons avec les eaux de surface differentes. Les distributions spatiales et temporelles des parametres mesures ont ete discutes en considerant independamment chacun des aquiferes etudies puis a l'echelle de leurs plaines alluviales. Les parametres bacteriens mesures sont en relation avec les quantites de cod disponibles dans le milieu. La dynamique des assemblages faunistiques depend principalement des liaisons des aquiferes avec les eaux de surface et de la qualite des eaux souterraines (en particulier des teneurs en oxygene). A notre connaissance, ce travail experimental est l'un des premiers mettant en evidence l'existence de relations entre la matiere organique, les bacteries et la faune dans ces ecosystemes.