thesis

Etude des mecanismes de degradation de l'arnm rpso codant la proteine ribosomique s15 d'escherichia coli

Defense date:

Jan. 1, 1997

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Institution:

Paris 7

Disciplines:

Directors:

Abstract EN:

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Abstract FR:

Le gene rpso d'escherichia coli est transcrit sous forme de messager monocistronic ou discistronique avec le gene pnp localise en aval. La degradation de l'arnm rpso est une des mieux caracterisee. Deux voies de degradation ont ete mises en evidence. La premiere implique une coupure endoribonucleolytique par la rnasee qui rend accessible l'extremite 3' aux exoribonucleases 3'-5': la pnpase et la rnase ii. Cependant, la detection d'intermediaires de degradation dans une souche deficiente en pnpase, mais pas dans une souche deficiente en rnase ii ni meme dans une souche sauvage, indique que la rnase ii est arretee dans sa progression au niveau des extremites 3' de ces fragments d'arnm probablement parce qu'elles forment des structures secondaires. Nous en avons conclu que le transcrit mature par la rnase e au site m2 est degrade exonucleolytiquement et que la pnpase est responsable in vivo de sa degradation rapide. Par ailleurs, la proximite du site rnase e, m2, et du codon de terminaison de la traduction suggere l'existence d'un couplage entre traduction et degradation du a un empechement sterique entre les ribosomes et la rnase e. Nous avons etudie l'influence de la traduction sur la stabilite d'arnm rpso traduits avec des efficacites differentes ou d'arnm dont le site rnase e, m2, a ete espace du codon d'arret de la traduction. Nos resultats montrent clairement que les ribosomes affectent l'efficacite de coupure de la rnasee au site m2 et que la stabilite de l'arnm rpso varie avec l'efficacite de la traduction. La seconde voie de degradation est active en absence de rnase e, pnpase et rnase ii. Les ribonucleases qui participent a cette degradation n'ont pas encore ete identifiees. Nous avons cependant montre que cette degradation implique une polyadenylation de l'arnm rpso et que le gene pcnb codant la poly(a)polymerase i est responsable de la destabilisation de l'arnm dans ces conditions.