thesis

Dynamique de l'adn pendant l'electrophorese en champ pulse

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Jan. 1, 1991

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Abstract FR:

Ce travail etudie experimentalement la dynamique des molecules d'adn dans un gel d'agarose lors de l'electrophorese en champ pulse. Pour cela, nous avons construit un appareil entierement automatise pour suivre la birefringence de l'adn dans un gel a l'etablissement, puis a la coupure du champ electrique. Des adn de differentes longueurs ont ete etudies en fonction du champ electrique et de la concentration d'agarose qui determine la taille des pores du gel. La relaxation de la birefringence a la coupure du champ permet de caracteriser 2 phenomenes: l'un est attribue a l'alignement du tube dans la direction du champ, l'autre au suretirement de la chaine dans son tube. La contribution la plus importante a l'orientation moleculaire est apportee par le suretirement qui relaxe suivent une loi exponentielle etiree, alors que la disparition de l'alignement, lent, fournit un temps de reptation et un facteur d'alignement du tube en accord avec le modele de reptation biaisee sans suretirement. A l'etablissement du champ electrique, le signal passe par un maximum suivi d'un leger minimun avant d'atteindre une valeur plateau. En coupant le champ electrique a differents intervalles de temps inferieurs a l'atteinte de la valeur au plateau, l'analyse des courbes de relaxation correspondantes montre que ce depassement de la valeur d'equilibre de la birefringence est du au phenomene de suretirement et que le maximum du depassement correspond a la sortie de l'adn de son tube initial. Un modele rendant compte de l'ensemble des resultats est compare aux modeles theoriques et aux simulations sur ordinateur recemment apparus dans la litterature. Differentes hypotheses et explications sur les ecarts rencontres sont donnees