Diversité intraspécifique des Pseudomonas brassicacearum associés à la rhizosphère d'Arabidopsis thaliana
Institution:
Aix-Marseille 1Disciplines:
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Les populations de pseudomonas brassicacearum isolees de la rhizosphere d'arabidopsis thaliana, plante modele choisie pour l'etude des interactions plante - rhizobacteries, ont ete caracterisees. En parralele a un travail collectif ayant conduit a la description taxonomique de cette nouvelle espece bacterienne (achouak w. , sutra l. , heulin t. , fromin n. , meyer j. -m. , degraeve s. , christen r. Et gardan l. , description of pseudomonas brassicacearum sp. Nov. And pseudomonas thivervalensis sp. Nov. For arabidopsis thaliana and brassica napus root-associated bacteria, int. J. Syst. Bacteriol. , soumis), nous avons defini dans ce travail des criteres phenotypiques (morphologie de colonies sur milieu semi-selectif, typage des siderophores) et genotypiques (profils de restriction de l'adnr 16s amplifie par pcr) pour l'isolement et l'identification de p. Brassicacearum a partir d'echantillons de sol et de la rhizosphere d'a. Thaliana. Des populations de p. Brassicacearum ont ete isolees de la rhizosphere de deux ecotypes d'a. Thaliana (ws et columbia) et du mutant pgm (mutant de columbia deficient en phosphoglucomutase chloroplastique) cultives en conditions controlees. La diversite de ces populations a ete caracterisee par la realisation de profils metaboliques (biolog) et d'empreintes genotypiques (rep-pcr). L'analyse des frequences de distribution des differents genotypes de p. Brassicacearum a permis de mettre en evidence que la structure genetique des populations de p. Brassicacearum etait differente d'un ecotype a l'autre (ws vs columbia). Cette analyse a egalement revele l'existence d'un genotype bacterien frequent et present quelle que soit la fraction etudiee (rhizosphere des differents genotypes d'a. Thaliana, sol non-rhizospherique) alors que certains genotypes bacteriens semblaient plus specifiquement stimules en presence d'un genotype vegetal particulier.