Abstract FR:

Nous avons etudie les contraintes fonctionnelles et structurales qui agissent sur les regions non-codantes du genome des vertebres, a travers l'analyse comparative et statistique des sequences homologues presentes dans les banques de donnees. Pour cela, nous avons concu hovergen, une banque de donnees des genes homologues de vertebres, specialement dediee aux etudes evolutives et comparatives. Nous avons montre que l'organisation du genome des vertebres peut imposer certaines contraintes sur la structure des genes qu'il contient: dans les regions riches en g+c, les genes sont plus compacts que dans les regions pauvres en g+c. Cette observation est discutee au regard de la structure de la chromatine, de la distribution des genes, des elements repetes et des evenements de recombinaison le long du genome. La comparaison de genes homologues provenant de differentes classes de vertebres a revele l'existence de longues regions non codantes tres fortement conservees (hcr) depuis plus de 300 millions d'annees. L'analyse de ces hcr a montre qu'elles sont relativement frequentes, en particulier dans les regions 3' non-codantes transcrites des genes essentiels au fonctionnement cellulaire. La localisation des hcr suggere que celles-ci sont impliquees dans des mecanismes post-transcriptionnels. La longueur des regions non codantes fonctionnelles que nous avons identifiees (100-1450 nt) est surprenante car elle depasse nettement la taille des elements regulateurs connus a ce jour