thesis

Caractérisation génétique de Frankia nodulant les casuarinacées : influence de la plante-hôte et de sa zone d'origine, l'Australie

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Jan. 1, 1995

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Institution:

Lyon 1

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Frankia est un actinomycete du sol capable d'etablir une symbiose fixatrice d'azote avec 8 familles de plantes dites actinorhiziennes. Les casuarinacees sont une famille de plantes actinorhiziennes tropicales. Nous avons etudie la diversite genetique de frankia associe au genres casuarina et allocasuarina. Ces 2 genres sont originaires d'australie, et quelques especes appartenant au genre casuarina (principalement l'espece casuarina equisetifolia) ont ete exportees vers presque toutes les zones tropicales. Du fait d'un isolement difficile, peu de souches de frankia sont disponibles. Elles ont ete principalement isolees d'une espece, casuarina equisetifolia, et hors de l'australie. Des etudes precedentes avaient montre que ces souches etaient genetiquement tres proches. Dans un premier temps, l'homogeneite genetique des souches isolees a ete confirmee par le sequencage d'une zone a priori tres variable de l'operon ribosomal, l'igs entre les arnr 16s et 23s. Une methode de caracterisation genetique de frankia directement au niveau du nodule a ensuite ete developpee. Tout d'abord sur des nodules preleves en australie sur cinq especes de casuarina et d'allocasuarina. Cinq groupes genetiques composes de souches non-isolees ont ete mis en evidence et semblent lies a l'espece de la plante-hote. Par contre, dans les zones d'introduction etudiees, un seul groupe semble present, quelle que soit l'espece de la plante-hote. En australie, ce groupe semble uniquement associe a casuarina equisetifolia. Ce groupe pourrait avoir ete exporte a partir de l'australie, avec sa plante-hote. Enfin, une methode de detection et de caracterisation de frankia-casuarinacees dans le sol a permis de comparer la diversite genetique dans le sol par rapport a celle retrouvee au niveau du nodule. Il semblerait que le groupe retrouve dans le nodule soit le seul detecte dans le sol environnant le plante-hote. La plante-hote pourrait favoriser le developpement de son genotype de frankia associe