thesis

Utilisation de l'outil moleculaire pour la reconstruction d'une phylogenie des plantes monocotyledones en general et de la famille des poaceae

Defense date:

Jan. 1, 1994

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Institution:

Paris 11

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L'objectif du travail etait de tester la validite de l'outil moleculaire pour la reconstruction de phylogenies chez les angiospermes. L'etude a ete menee a deux niveaux taxonomiques differents: les monocotyledones en general, et la famille des poaceae en particulier. Un echantillonnage representatif de la diversite de ces deux groupes a ete effectue: 62 especes de monocotyledones, dont 36 sont des poaceae, ont ete selectionnees. Deux sequences ont ete choisis pour servir de base a cette etude: la partie 5 du gene ribosomique 26s nucleaire, et le gene chloroplastique rps4. Ce dernier a ete sequence pour chacune des especes choisies. Des arbres phylogenetiques ont ete deduits des sequences. Les resultats obtenus ont ete compares avec les classifications et les phylogenies disponibles dans la litterature. Le gene rps4 s'est avere un bon outil phylogenetique au niveau de la famille des poaceae: il permet de retrouver les traits communs des classifications, et permet egalement d'apporter des elements nouveaux quant a la position de certains genres traditionnellement difficiles a classer. Au niveau des monocotyledones, le gene rps4 presente un taux de variation insuffisant pour etablir de facon non ambigue les relations de parente entre les grands lignages. Nos resultats rejoignent ceux obtenus avec le gene chloroplastique rbcl sur plusieurs aspects, en particulier au niveau de la position de l'espece acorus calamus, qui apparait comme un representant des premieres monocotyledones. La partie 5 du gene 26s a ete amplifiee par pcr chez quelques monocotyledones. Le clonage a fait apparaitre une heterogeneite de sequence dans les produits de pcr. Ceci nous a conduit a proposer une hypothese selon laquelle plusieurs types de sequences 26s co-existeraient dans le genome des plantes superieures. Plusieurs experiences complementaires sont prevues afin de tester cette hypothese