thesis

Etude des relations entre topologie de l'adn et transcription chez un organisme procaryote modele : salmonella typhimurium

Defense date:

Jan. 1, 1996

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Institution:

Paris 6

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Abstract FR:

La topologie de l'adn peut etre modifiee localement par la translocation du complexe transcriptionnel le long de l'adn: ce processus genere un domaine de surenroulement negatif derriere l'arn polymerase et un domaine de surenroulement positif devant. L'action des adn topoisomerases, qui changent la topologie de l'adn a travers une reaction de coupure et refermeture de la double-helice, est necessaire pour relacher ces contraintes. Nous avons aborde le probleme du mecanisme responsable des changements topologiques de plasmides en fonction de leur activite transcriptionnelle. Nous avons conduit notre etude dans des souches de s. Typhimurium sauvages ou mutees dans les genes codant pour les adn topoisomerases en considerant le role joue par la force du promoteur et la nature du gene transcrit. Les resultats obtenus nous permettent de definir deux composantes dans les effets de la transcription sur le surenroulement de l'adn. La premiere est en relation avec l'ouverture de la double-helice par l'arn polymerase, la deuxieme est liee aux perturbations topologiques produites lors de la phase d'elongation de la transcription. L'etendue de ces perturbations est etroitement dependante de la localisation cellulaire de la proteine exprimee. Nous avons egalement etudie l'effet de la transcription du gene tet qui code pour une proteine membranaire et du gene cat qui code pour une proteine cytosolique sur l'etendue de la tension superhelicale produite en amont du promoteur. Nous avons montre qu'il n'y a pas de correlation directe entre la tension libre negative et le deficit de lk de l'adn. Nous proposons qu'une partie du surenroulement negatif produit lors de la transcription des genes codant pour des proteines de membrane en absence d'activite topoisomerase i peut etre sous forme contrainte in vivo. Une deuxieme partie du travail porte sur la caracterisation des effets du surenroulement produit par la transcription en amont et en aval du promoteur leu-500 sur son activite dans un contexte topa#-. Les resultats obtenus montrent que l'activite transcriptionnelle en aval de leu-500 peut augmenter de facon considerable son expression. Les mecanismes permettant d'interpreter ce phenomene et les consequences biologiques de ces observations sont discutes