Abstract FR:

Ce travail en spectroscopie optique (ftir, uv, fluorescence) a permis de determiner les conditions de formation, la stabilite, l'appariement des bases de double helices d'adn a brins paralleles et d'analyser la reconnaissance d'une sequence d'adn en double helice a partir de sites situes dans son grand sillon, d'une part en utilisant un oligonucleotide formant une triple helice d'autre part un intercalant muni de bras peptidiques. Le chapitre 1 porte sur les structures d'adn en double helices paralleles avec deux appariements differents. Le schema d'appariement trans-watson-crick connu pour les paires de bases a-t a ete complete par celui des paires g-c. Les paires g-c formees ont deux liaisons hydrogene. Les paires trans-watson-crick g-c et a-t ne sont pas isomorphes ce qui explique que la stabilite de la double helice parallele diminue quand le nombre de jonctions entre paires a-t et g-c augmente. La seconde structure parallele, limitee aux sequences homopurine-homopyrimidine, se forme avec un appariement hoogsteen a ph acide. Elle a ete stabilisee soit par des ions mg#2#+ soit par des intercalants (benzopyridoindoles). Ce meme type d'intercalant pourra stabiliser en orientation parallele par liaisons hoogsteen des oligonucleotides synthetiques sur une cible d'adn. Le chapitre 2 est consacre a l'etude de l'orientation du troisieme brin dans des triple helices ou la sequence du troisieme brin est centrosymetrique (g#3a#4g#3 et g#3t#4g#3). La fixation covalente de pyrene aux extremites des brins formant la triple helice a permis, par detection ou non de la formation d'excimere, de determiner l'orientation relative de ces brins. De plus l'etude de la cinetique de formation de la triple helice d(c#3t#4c#3)-d(g#3a#4g#3)#2 faite en marquant les deux brins cis-watson-crick suggere un mecanisme d'echange entre les brins homologues d(g#3a#4g#3). Le chapitre 3 concerne les complexes d'un derive de la porphyrine pourvue de bras arginyles (bap), avec des adn en double helices de differentes sequences. Les donnees de denaturation thermique en uv indiquent que bap, stabilise preferentiellement la double helice d(ggcgcc)#2 (que l'on retrouve dans le site pbs de hiv-1). Les spectres ir des complexes ont montre que bap, par ses bras peptidiques, interagit dans le grand sillon avec les sites n7 et o6 des guanines.