Abstract FR:

La biogenese des ribosomes se deroule dans un compartiment nucleaire dedie, le nucleole, ou l'arn preribosomique subit de nombreux decoupages et modifications de nucleotides impliquant l'intervention d'un grand nombre de petits arns (snoarns). Les sites des modifications de nucleotides les plus frequentes dans l'arnr (methylations en 2-o du ribose et pseudouridylations) sont specifies par l'appariement au pre-arnr de deux familles distinctes de snoarns, qui forment une structure en duplex reconnue par une enzyme specifique de chaque type de modification. Pour assister le biologiste dans l'analyse des relations structure/fonction des arns, nous avons d'abord developpe essa. C'est un logiciel de visualisation, d'edition, et d'analyse de structure secondaire adapte a des arns de structure aussi complexe que les arnr. Essa est un outil graphique et interactif, utilisable quelle que soit la famille d'arn etudie, qui pourra servir ulterieurement de base a de nouveaux developpements dans le domaine de l'analyse du repliement tridimensionnel des arnr et de leurs precurseurs. Dans la perspective de rechercher dans le genome complet de la levure s. Cerevisiae de nouveaux snoarns a boites h/aca, les guides de pseudouridylation du pre-arnr, nous avons ensuite adapte un logiciel de recherche de motifs arns structures, palingol, en y incorporant des fonctions de detection de motifs en sequence. Nous avons pu detecter de nombreuses sequences positives parmi lesquelles pourront etre experimentalement recherches de nouveaux snoarns h/aca, et aussi obtenir de nouvelles informations sur les cibles probables de plusieurs snoarns deja connus. Enfin, nous avons recherche dans le genome complet de s. Cerevisiae les enzymes susceptibles de catalyser la methylation ribose et la pseudouridylation de l'arn, par analyse de sequences proteiques. Outre la detection de trois pseudouridine synthases putatives, ce travail a conduit a l'identification et la caracterisation experimentale de la premiere 2-o-ribose methylase eucaryotique, qui est specifique d'une position unique dans les arnt.