thesis

Identification et etude de couples analogues a recbcd-chi chez lactococcus lactis et haemophilus influenzae

Defense date:

Jan. 1, 1998

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Institution:

Paris 7

Disciplines:

Directors:

Abstract EN:

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Abstract FR:

La vie d'un micro-organisme depend de la machinerie proteique programmee par l'information genetique contenue dans le genome. Or l'apparition d'une cassure double-brin sur l'adn risque de conduire a une alteration de cette information. Chez escherichia coli, ces cassures sont reparees principalement par le couple recbcd-chi. Recbcd est une enzyme multifonctionnelle qui degrade les molecules d'adn lineaire. Si elle rencontre un octanucleotide appele chi (5-gctggtgg-3), son activite exonuclease est modulee et il subsiste une activite helicase qui permet la reparation de la molecule par recombinaison homologue. Nous avons identifie des analogues du couple recbcd-chi dans des micro-organismes phylogenetiquement eloignes d'e. Coli. Nous avons mis en evidence un couple analogue a recbcd-chi chez lactococcus lactis (bacterie a gram positif). Nous avons isole un mutant de l. Lactis ou l'analogue de recbcd est inactive et clone les genes specifiant cette proteine. Elle permet la complementation d'un mutant recbcd d'e. Coli et elle interagit specifiquement avec une sequence (5-gcgcgtg-3) appelee chi de l. Lactis, qui attenue son activite exonuclease et stimule la recombinaison. Nous avons aussi etudie la repartition sur le chromosome de la sequence chi d'e. Coli et de celle de h. Influenzae. La sequence chi de h. Influenzae est degeneree (5-gntggtgg-3 et 5-g(g/c)tggagg-3). Les deux sites chi sont frequents sur leur chromosome et statistiquement sur-representes par rapport a une sequence aleatoire de meme taille. Neanmoins, la sur-representation du site chi d'e. Coli est plus forte et il presente un biais d'orientation par rapport a la replication. Ainsi, il semble que le role des sequences chi concernant l'attenuation de l'exonuclease soit conserve, mais que les caracteristiques de leur repartition sur le chromosome soient differentes et refletent les specificites de chaque organisme.