thesis

Caracterisation, pathogenie et epidemiologie de pseudomonas fuscovaginae, agent de la pourriture brune des gaines du riz (oryza sativa)

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Jan. 1, 1995

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Institution:

Paris 11

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La pourriture brune des gaines du riz causee par pseudomonas fuscovaginae est la principale contrainte pathologique de la riziculture des zones tropicales d'altitude en afrique, en asie et en amerique du sud. L'etude de 72 echantillons de pourritures de gaine collectees a madagascar et au nepal en 1991 et 1992 a permis d'isoler 162 isolats bacteriens dont 65% induisent une pourriture de gaine apres inoculation sur riz au stade plantule. La caracterisation physiologique basee sur 8 tests biochimiques permet de regrouper les 106 isolats pathogenes sur riz au stade plantule en 11 groupes biochimiques. Nous avons approfondi les relations genetiques entre ces differentes groupes et les especes de reference des pseudomonas spp. Fluorescents par l'analyse pcr/rflp du gene codant pour l'arn16s. P. Fuscovaginae constitue un groupe phylogenetique polymorphe distinct des autres isolats de pourriture des gaines et des differents biovars de p. Fluorescens et p. Putida et de p. Syringae pv. Syringae. Les autres isolats de pourritures des gaines se distribuent dans tout le phylum des pseudomonas spp. Fluorescents. L'expression du pouvoir pathogene de pseudomonas fuscovaginae sur riz au stade gonflement a ete analysee aux temperatures de 13c, 18c et 23c. Nos resultats permettent de conclure que les basses temperatures agissent negativement sur les differents processus de pathogenie de pseudomonas fuscovaginae. La distribution de p. Fuscovaginae dans les zones ou les basses temperatures sont limitantes pour la riziculture ne peut donc pas etre expliquee par une action directe des temperatures sur le pathogene. L'epidemiologie de la pourriture des gaines a ete etudiee dans differentes localites de madagascar en 1991, 1992 et 1993. L'incidence de la maladie augmente avec l'altitude de 0,1% a 1250 metres a 12% a 1875 metres en 1992. L'analyse de l'evolution au cours du temps de la maladie et du developpement de l'hote met en evidence que la dynamique de l'epidemie de pourriture de gaine est directement liee a la dynamique d'apparition du stade epiaison, le stade receptif de l'hote. La croissance du riz etant dependante de la temperature, l'augmentation de l'incidence avec l'altitude peut etre expliquee par une augmentation de la duree du stade receptif dues a la diminution des temperatures