thesis

Initiation de la retrotranscription du virus de l'immunodeficience humaine de type 1 (hiv-1) : specificites structurales et fonctionnelles

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Jan. 1, 1998

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Abstract FR:

La retrotranscription de l'arn genomique en adn proviral par la retrotranscriptase (rt) est une etape importante du cycle replicatif retroviral. L'initiation de la retrotranscription debute par la reconnaissance par la rt du complexe forme par le tarn amorce hybride par son extremite 3 a la region pbs de l'arn genomique. Une etude structurale realisee dans notre laboratoire a montre que le complexe tarn#3#l#y#s/arn viral de hiv-1 est tres structure et qu'il fait intervenir des interactions additionnelles et complexes entre les deux molecules, en plus de l'interaction classique entre l'extremite 3 du tarn et la region pbs de l'arn genomique. Mon travail de these a consiste a etudier les parametres cinetiques de la retrotranscription de hiv-1 a partir du complexe tarn#3#l#y#s/arn viral et a caracteriser d'un point de vue fonctionnel et structural le mecanisme de transition de la phase d'initiation vers la phase d'elongation. Nous avons montre que le debut de la retrotranscription est un processus biphasique, avec une phase d'initiation specifique suivie d'une phase d'elongation non-specifique. Une comparaison detaillee des deux phases indique une difference de processivite due a une dissociation de la rt plus rapide du complexe d'initiation que du complexe d'elongation et a une polymerisation plus rapide en elongation qu'en initiation. La synthese d'adn est distributive lors de l'initiation et processive lors de l'elongation. L'analyse de la transition entre l'initiation et l'elongation montre que la vitesse de polymerisation augmente entre l'addition du sixieme et du septieme nucleotide, alors que la vitesse de dissociation de la rt diminue entre l'addition du dix-septieme et du dix-neuvieme nucleotide. L'analyse structurale de la transition indique un remaniement structural important du complexe tarn#3#l#y#s/arn viral entre l'addition du troisieme et du sixieme nucleotide. De par ses specificites structurales et fonctionnelles, la phase d'initiation pourrait constituer une cible privilegiee pour des inhibiteurs diriges contre cette etape de la retrotranscription de hiv-1.