Abstract FR:

Alors que de nombreuses etudes microbiologiques ont ete entreprises dans les digesteurs, sur le role des bacteries anaerobies intervenant dans la degradation des composes aromatiques dans des conditions methanogenes, peu de donnees sont disponibles concernant la degradation anaerobie des composes aromatiques dans des conditions non methanogenes, ou aucune trace de sulfato-reduction n'a ete detectee. De plus, depuis que la degradation des composes aromatiques en anaerobiose a ete mise en evidence, la plupart des etudes ont ete realisees sur la degradation d'un compose pur, soit par un consortium defini, soit par une culture pure, sans pour autant suivre la cinetique de la degradation de chacun de ces composes quand ils se trouvent en presence d'autres composes aromatiques. Cependant, dans les sites contamines par des composes aromatiques, il est rarissime de trouver un seul compose d'une classe bien precise qui soit le seul responsable du caractere polluant du site. Partant du principe que les sites contamines peuvent l'etre par un ensemble de composes aromatiques dont certains sont majoritaires, la premiere partie de ce travail a eu pour objectif de mettre en evidence l'effet du melange de trois composes aromatique types (benzoate, syringate et cinnamate) sur la cinetique de degradation de chacun de ces composes. Une etude comparative a ete entreprise sur deux consortiums types capables de degrader ces structures aromatiques, le premier non methanogene (ci) et le second methanogene (cii). Ces consortiums proviennent respectivement de digesteurs (non methanogene et methanogene) traitant tous deux des tourteaux de karite. Cette etude a permis de montrer que selon les conditions presentes dans le milieu, la degradation des composes aromatiques peut etre ou non etroitement liee au transfert interespece d'hydrogene. Nous avons egalement montre que la degradation d'un compose aromatique peut necessiter la presence d'un autre compose aromatique pour etre effective. Nos travaux ont permis egalement d'isoler et de caracteriser a partir du consortium methanogene (cii), deux especes bacteriennes capables de degrader les structures aromatiques etudiees. Une espece est de type fermentaire (souche cin1 t) et la seconde est de type syntrophe (souche ben1 t). La souche cin1 t est capable de degrader le cinnamate selon une voie nouvelle, en condition d'anaerobiose stricte. La souche ben1 t est capable de degrader le benzoate en syntrophie avec un partenaire hydrogenotrophe. L'analyse phylogenetique des sequences du gene codant pour la sous unite 16s de l'arn ribosomal (arnr-16s) de cin1 t et ben1 t a permis de classer la souche cin1 t comme une espece d'un nouveau genre bacterien, papillibacter cinnamivorans et la souche ben1 t comme appartenant au genre syntrophus. Cette derniere presente 99% de similitude avec l'espece syntrophus buswellii, mais montre suffisamment de differences phenotypiques et physiologiques pour envisager son positionnement taxonomique comme nouvelle espece du genre syntrophus.