thesis

Etude moleculaire de campylobacter jejuni et de campylobacter coli : sondes nucleotidiques specifiques d'espece, caracterisation de plasmides, applications au diagnostic

Defense date:

Jan. 1, 1995

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Institution:

Paris 6

Disciplines:

Directors:

Abstract EN:

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Abstract FR:

Deux methodes ont ete developpees pour detecter et identifier chacun des deux pathogenes majeurs du genre campylobacter, campylobacter jejuni et campylobacter coli. Les sondes nucleotidiques decrites dans ces methodes, utilisees avec la technique d'amplification enzymatique in vitro (pcr), permettent une detection specifique, sensible et rapide de c. Jejuni et de c. Coli dans des cultures bacteriennes ou dans des echantillons cliniques ou alimentaires. La validite de ces sondes a ete testee et confirmee sur plus de 270 souches de sources et d'origines geographiques tres differentes. Grace a la haute specificite de ces sondes, il a ete possible d'identifier correctement quelques souches de c. Jejuni et de c. Coli mal identifiees par des methodes conventionnelles. Les conditions de preparation des echantillons pour la detection par pcr ont egalement ete etudiees. Les methodes developpees dans ce travail ouvrent des perspectives interessantes pour le diagnostic rapide des infections a c. Jejuni et a c. Coli, frequentes en pathologie humaine et veterinaire. Parallelement, deux plasmides cryptiques ont ete identifies dans la souche type c. Coli cip 70. 80#t. Leurs sequences nucleotidiques respectives ont ete determinees et leur organisation moleculaire a ete analysee, faisant apparaitre des homologies structurales avec des plasmides dont le mode de replication est de type theta. Des recherches supplementaires sont necessaires pour determiner les mecanismes de regulation des fonctions de ces plasmides. Une application immediate du caractere souche-specifique de ces plasmides a ete leur utilisation comme moyen de caracterisation et d'identification de la souche type c. Coli cip 70. 80#t dans les collections de microorganismes