thesis

Phylogénies moléculaires déduites des comparaisons de séquences d'ARN ribosomiques : analyse des méthodes par comparaison aux données paléontologiques (echinodermes) : application a l'étude des procaryotes

Defense date:

Jan. 1, 1993

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Institution:

Nice

Disciplines:

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Abstract FR:

Il est possible d'etudier les liens de parente entre les organismes (relations phylogeniques) par comparaison de sequences d'acides nucleiques. Parmi ceux-ci, les ARN ribosomiques constituent les index phylogeniques les plus utilises. Nous avons etudie l'adequation de cette molecule comme index phylogenique et les efficacites relatives des differentes methodes de reconstruction de phylogenie a partir de donnees moleculaires. Pour cela, nous avons retenu le phylum des echinodermes comme systeme modele, car la phylogenie de ce groupe est bien determinee grace a l'abondance de fossiles. Les differentes methodes (matrice des distances, maximum de parcimonie, maximum de vraisemblance) ont ete appliquees a la comparaison des sequences d'ARN ribosomiques d'echinides et d'asterides, et les phylogenies obtenues analysees par rapport aux donnees morphologiques et paleontologiques. Ce travail nous a conduit a proposer une strategie d'etude des donnees moleculaires et des criteres pour le choix des especes et des positions nucleotidiques a utiliser. Ces resultats ont ensuite ete appliques a 1-analyse phylogenique d'organismes procaryotes, pour lesquels les donnees morphologiques sont pauvres. Les sequences alignees d'ARN ribosomiques 16s ont ete organisees sous forme d'une banque de donnees (sur ordinateur pc-compatible) pour rendre les sequences facilement accessibles et utilisables dans les etudes de phylogenie