Caractérisation de certains impacts de la mutation "Laurina" chez "Coffea arabica L. " aux niveaux histo-morphologique et moléculaire
Institution:
La RéunionDisciplines:
Directors:
Abstract EN:
Coffea arabica var. Laurina ("Bourbon Pointu") appeared on Reunion Island following a spontaneous mutation in the Bourbon variety. The aim of the thesis was to better characterize the mutation pleiotropic effects by comparing Bourbon pointu and Bourbon. The pyramidal shape of Bourbon pointu was analysed with vegetative growth. Dwarfism of the orthotropic axis was explained in terms of cell size and cell number from studies in the apex and in internodes. Gibberellins application allowed hypothesis to form concerning effects of the mutation on some hormones. These observations and conclusions led to Bourbon and Bourbon pointu being evaluated at the transcription level, to identify candidate genes showing modified expression. Differentially expressed genes were identified by differential cloning with SSH (Suppressive Soustractive Hybridation) method and macro-arrays technique. The results open the way to the molecular characterization of thé Laurina mutation based on candidate gene
Abstract FR:
Le caféier Coffea arabica var. Laurina (« Bourbon Pointu ») est apparu à la Réunion suite à la mutation spontanée Laurina de la variété Bourbon. Ce travail a pour objectif de caractériser les effets pléiotropiques de cette mutation, monolocus et récessive, en comparant le Bourbon pointu avec le Bourbon. La forme pyramidale du mutant a été analysée par des mesures de croissance végétative. L'étude de l'apex et des entre-nœuds a expliqué l'origine du nanisme en terme de division et d'élongation cellulaire. Des hypothèses sur l'action de la mutation par des hormones ont été émises suite aux résultats d'application de gibbérelline. La comparaison des transcriptomes a permis la recherche de gènes différentiellement exprimés entre les deux variétés. Le clonage différentiel par SSH (Hybridation Suppressive Soustractive) couplé à une étape de tri (macro-array) a été utilisé. Les résultats ouvrent des pistes sur la caractérisation moléculaire de cette mutation par une approche gène candidat.